More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3322 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3322  histidine kinase  100 
 
 
278 aa  536  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.770446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  48.61 
 
 
513 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.24 
 
 
511 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  48.24 
 
 
513 aa  230  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  48.24 
 
 
513 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.4 
 
 
512 aa  229  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.52 
 
 
513 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.1 
 
 
531 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.01 
 
 
530 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 
511 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.01 
 
 
530 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  47.81 
 
 
532 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  47.2 
 
 
536 aa  219  5e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.21 
 
 
533 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  44.12 
 
 
511 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.41 
 
 
536 aa  218  8.999999999999998e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.49 
 
 
505 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  41.88 
 
 
511 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 
511 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 
594 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.06 
 
 
518 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.56 
 
 
509 aa  211  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 
523 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 
600 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 
717 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 
583 aa  179  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  39.84 
 
 
773 aa  177  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.57 
 
 
798 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 
844 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 
911 aa  172  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 
620 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  39.53 
 
 
790 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 
782 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 
786 aa  168  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  40.84 
 
 
774 aa  168  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  34.96 
 
 
470 aa  167  1e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 
468 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 
764 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
1296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 
775 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 
1192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
1276 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 
1138 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0543  PAS sensor protein  42.29 
 
 
786 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0831512  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0680  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 
728 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
502 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 
784 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 
786 aa  163  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  36.19 
 
 
1410 aa  162  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
389 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 
773 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 
1000 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420098  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3481  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 
704 aa  162  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.112139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 
969 aa  161  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  36.95 
 
 
1035 aa  161  9e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
836 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 
772 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 
770 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 
779 aa  159  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
617 aa  159  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 
562 aa  158  7e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 
484 aa  158  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1549  sensory box histidine kinase  36.02 
 
 
1035 aa  158  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 
494 aa  158  9e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 
774 aa  158  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3923  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
1055 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.13 
 
 
646 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
769 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
769 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  43.72 
 
 
648 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
795 aa  156  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  39.91 
 
 
783 aa  155  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 
797 aa  155  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  39.91 
 
 
783 aa  155  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  33.46 
 
 
470 aa  155  8e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 
643 aa  155  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  41.45 
 
 
508 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 
778 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 
513 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
769 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
377 aa  152  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  39.78 
 
 
599 aa  152  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 
775 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 
1352 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1778  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 
606 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415214  decreased coverage  0.0072817 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  36.23 
 
 
288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.54 
 
 
605 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0997338  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  39.22 
 
 
771 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
573 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1834  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 
569 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0577  sensor histidine kinase  40.17 
 
 
609 aa  146  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.704828  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 
763 aa  147  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0577  sensor histidine kinase  40.17 
 
 
609 aa  146  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 
587 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  37.45 
 
 
503 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.68 
 
 
1002 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
1031 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244216  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0877  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 
548 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.991624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 
579 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
630 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.591777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>