15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3320 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3320  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2628  hypothetical protein  30.1 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.460391  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1939  hypothetical protein  30.67 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0577581  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2056  hypothetical protein  32.32 
 
 		 292 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2228  hypothetical protein  30.14 
 
 		 274 aa  96.3  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00178512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1773  hypothetical protein  51.43 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185989  decreased coverage  0.00548408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3041  hypothetical protein  65.85 
 
 		 321 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  25.95 
 
 		 2449 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3520  hypothetical protein  37.5 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  28.8 
 
 		 3409 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3299  hypothetical protein  47.83 
 
 		 330 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1675  hypothetical protein  35.48 
 
 		 333 aa  45.4  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1645  hypothetical protein  34.33 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5904  hypothetical protein  44.19 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188041  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3499  hypothetical protein  44.44 
 
 		 340 aa  42.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.449535 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>