More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2023 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2023  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 596 aa  1191    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.175935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 662 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0092  signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 		 570 aa  154  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0277499 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2929  signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 593 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1271  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 593 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3834  signal transduction histidine kinase  24.96 
 
 		 578 aa  113  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.391649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2700  signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 		 592 aa  112  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 603 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3926  signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 512 aa  98.2  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 551 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3564  signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 		 594 aa  94.7  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.186387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 1227 aa  91.3  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 909 aa  88.6  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2819  signal transduction histidine kinase  23.55 
 
 		 597 aa  87.8  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753757 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2724  signal transduction histidine kinase  24.11 
 
 		 613 aa  87.4  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.524296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 		 674 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 472 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 526 aa  84  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  29.25 
 
 		 744 aa  83.6  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 681 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0051  signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 585 aa  82  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725839 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 215 aa  82  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 1714 aa  80.9  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 872 aa  80.5  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 439 aa  80.5  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 790 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 347 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 932 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 572 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 585 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 		 657 aa  78.2  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 774 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  37.5 
 
 		 650 aa  77.8  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 545 aa  77.8  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 493 aa  77.8  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 746 aa  77  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 1560 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 832 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 		 462 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 1051 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 815 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 488 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 749 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  33.86 
 
 		 1239 aa  75.1  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 964 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 		 764 aa  74.3  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 1093 aa  73.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 1390 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 532 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1093 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 1253 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 813 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 723 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 		 834 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 912 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 524 aa  72  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 547 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 437 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9026  sensory transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157622  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  30.72 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20510  signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101775  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 492 aa  71.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 613 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 941 aa  71.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4194  ATPase-like/sensor kinase  27.93 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 747 aa  71.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 788 aa  71.2  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4826  signal transduction histidine kinase  22.33 
 
 		 553 aa  71.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788722  normal  0.27838 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5177  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 492 aa  70.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 839 aa  70.9  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 913 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4164  hypothetical protein  28.24 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 1205 aa  70.5  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1629  signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 600 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 381 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0075  signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 358 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232772  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  24 
 
 		 1654 aa  70.1  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  26.11 
 
 		 624 aa  70.1  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 431 aa  70.1  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  24.27 
 
 		 756 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.9 
 
 		 1663 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3706  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  31.19 
 
 		 516 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0090  signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 871 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 924 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  34.17 
 
 		 1210 aa  69.3  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 616 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 721 aa  69.3  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 782 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  30 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.5 
 
 		 1668 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  30.99 
 
 		 783 aa  68.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>