136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1897 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1897  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
235 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.394264  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4375  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  55 
 
 
240 aa  216  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283206  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2408  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  51.36 
 
 
236 aa  215  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.553614  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2006  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  54.09 
 
 
246 aa  215  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0210769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50.64 
 
 
241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0233536  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0905  protein of unknown function DUF1332  50.64 
 
 
241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0299728  normal  0.285713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0880  heat shock protein DnaJ domain protein  50.21 
 
 
241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161205  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4909  protein of unknown function DUF1332  53.18 
 
 
245 aa  211  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296192  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1445  DnaJ domain-containing protein  52.26 
 
 
236 aa  198  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0302292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1401  DnaJ domain-containing protein  51.76 
 
 
236 aa  195  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.382181  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1731  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  51.26 
 
 
236 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2868  protein of unknown function DUF1332  46.22 
 
 
235 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2105  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.19 
 
 
235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0737  heat shock protein DnaJ domain protein  48.74 
 
 
227 aa  185  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120141  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1860  heat shock protein DnaJ-like  47.34 
 
 
235 aa  184  9e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0961  hypothetical protein  41.95 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.483965  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2019  heat shock protein DnaJ-like  51.56 
 
 
236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.37079  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2908  molecular chaperone DnaJ family  46.32 
 
 
245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2608  heat shock protein DnaJ domain protein  46.22 
 
 
235 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221974  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1801  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.08 
 
 
241 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3389  heat shock protein DnaJ-like  46.6 
 
 
235 aa  169  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0395  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.5 
 
 
227 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.32724  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0785  putative heat shock protein DnaJ  45.5 
 
 
227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2441  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.5 
 
 
227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525604  hitchhiker  0.00758559 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2092  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.63 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.764372  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3395  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.16 
 
 
231 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1747  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.51 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000151297  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2884  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.14 
 
 
256 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842041  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1139  heat shock protein DnaJ domain protein  38.37 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.632785  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2262  Dna-J like membrane chaperone protein  25.8 
 
 
296 aa  97.1  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1907  Dna-J like membrane chaperone protein  29.74 
 
 
271 aa  97.1  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2289  Dna-J like membrane chaperone protein  26.15 
 
 
296 aa  95.1  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0104  Dna-J like membrane chaperone protein  27.72 
 
 
271 aa  95.1  9e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000467525  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2075  Dna-J like membrane chaperone protein  27.34 
 
 
270 aa  91.7  9e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000570933  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1055  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.76 
 
 
267 aa  89  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00001887  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0892  Dna-J like membrane chaperone protein  28.85 
 
 
257 aa  85.5  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2106  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.12 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2813  Dna-J like membrane chaperone protein  28.79 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603068  normal  0.639961 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4621  heat shock protein DnaJ, N-terminal  29.53 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418995  normal  0.628986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5129  heat shock protein DnaJ-like  29.53 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.583171  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0885  Dna-J like membrane chaperone protein  27.78 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00720639  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3073  Dna-J like membrane chaperone protein  28.24 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70305  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2882  Dna-J like membrane chaperone protein  25.3 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450671  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0868  Dna-J like membrane chaperone protein  27.41 
 
 
259 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1085  Dna-J like membrane chaperone protein  28.46 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367802  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0557  DnaJ-like protein DjlA, putative  28.24 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0407  heat shock protein DnaJ domain protein  29.57 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1020  Dna-J like membrane chaperone protein  24.51 
 
 
259 aa  77  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.325317  normal  0.0319615 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0100  heat shock protein DnaJ-like protein  28.85 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00059  Dna-J like membrane chaperone protein  24.34 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3109  Dna-J like membrane chaperone protein  25.77 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00058  hypothetical protein  24.34 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000167853  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0438  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.18 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3544  heat shock protein DnaJ domain protein  24.34 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.15628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0061  Dna-J like membrane chaperone protein  24.34 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000128159  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3203  Dna-J like membrane chaperone protein  25.77 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.967283 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0049  Dna-J like membrane chaperone protein  24.34 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000477601  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0441  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.18 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524438  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0970  Dna-J like membrane chaperone protein  24.9 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0207673  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3600  Dna-J like membrane chaperone protein  24.34 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000271898  hitchhiker  0.00000323028 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  24.72 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000026636  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0911  Dna-J like membrane chaperone protein  25.77 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0269993  normal  0.373919 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  24.34 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000613097  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4522  Dna-J like membrane chaperone protein  26.28 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0061  Dna-J like membrane chaperone protein  23.97 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000204638  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0995  Dna-J like membrane chaperone protein  26.92 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03720  DnaJ domain containing protein  26.67 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.338466  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.46 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424531  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3415  Dna-J like membrane chaperone protein  24.73 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.258634  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0104  Dna-J like membrane chaperone protein  23.11 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141328  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0100  Dna-J like membrane chaperone protein  23.11 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000327368  normal  0.0501049 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0106  Dna-J like membrane chaperone protein  23.11 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000540131  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0101  Dna-J like membrane chaperone protein  23.11 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000130204  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0099  Dna-J like membrane chaperone protein  23.11 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3633  Dna-J like membrane chaperone protein  25.38 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0983  Dna-J like membrane chaperone protein  27.46 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.193447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1052  Dna-J like membrane chaperone protein  27.46 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0982922  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0826  heat shock protein DnaJ domain protein  28.78 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000315568  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0604  Dna-J like membrane chaperone protein  24.05 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000356276  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2989  Dna-J like membrane chaperone protein  27.44 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3306  Dna-J like membrane chaperone protein  28.28 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.044478  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1630  silent information regulator protein Sir2  26.26 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03410  Dna-J like membrane chaperone protein  25.6 
 
 
288 aa  64.7  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001661  DnaJ-like protein DjlA  24.67 
 
 
284 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1051  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  23.46 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2865  Dna-J like membrane chaperone protein  24.68 
 
 
284 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787957  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0020  Dna-J like membrane chaperone protein  26.34 
 
 
276 aa  63.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0397  heat shock protein DnaJ-like  25.87 
 
 
250 aa  61.6  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00812  Dna-J like membrane chaperone protein  24.02 
 
 
286 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0728  Dna-J like membrane chaperone protein  22.31 
 
 
273 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000304706  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3440  Dna-J like membrane chaperone protein  26.64 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000544251  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3569  Dna-J like membrane chaperone protein  26.28 
 
 
277 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000771944  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1837  DnaJ domain-containing protein  25.93 
 
 
264 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0768  Dna-J like membrane chaperone protein  26.28 
 
 
277 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128794  normal  0.0201885 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.88 
 
 
268 aa  59.3  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2781  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0742  hypothetical protein  27.75 
 
 
252 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1291  Dna-J like membrane chaperone protein  23.05 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4007  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.29 
 
 
253 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0668  DnaJ domain-containing protein  22.58 
 
 
265 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.165012  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0207  DnaJ domain-containing protein  22.46 
 
 
273 aa  55.5  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>