More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1673 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1673  malate dehydrogenase  100 
 
 		 327 aa  667    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00354849 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2474  malate dehydrogenase  78.22 
 
 		 327 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.487589  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3825  malate dehydrogenase  78.53 
 
 		 328 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0497  malate dehydrogenase  78.22 
 
 		 327 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0941878  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1751  malate dehydrogenase  78.22 
 
 		 327 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2336  malate dehydrogenase  78.22 
 
 		 327 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0795  malate dehydrogenase  78.22 
 
 		 327 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233421  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1827  malate dehydrogenase  78.22 
 
 		 327 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.723795  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1619  malate dehydrogenase  78.22 
 
 		 327 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3309  malate dehydrogenase  78.53 
 
 		 328 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4358  malate dehydrogenase  78.29 
 
 		 327 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4651  malate dehydrogenase  78.22 
 
 		 328 aa  502  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6858  malate dehydrogenase  77.06 
 
 		 327 aa  501  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.416763 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2154  malate dehydrogenase  77.61 
 
 		 328 aa  501  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0658  malate dehydrogenase  78.22 
 
 		 327 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3596  malate dehydrogenase  77.91 
 
 		 328 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2898  malate dehydrogenase  77.68 
 
 		 327 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4435  malate dehydrogenase  77.91 
 
 		 328 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3932  malate dehydrogenase  77.91 
 
 		 328 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.566421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2327  malate dehydrogenase  73.7 
 
 		 327 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2489  malate dehydrogenase  72.78 
 
 		 327 aa  467  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.210751 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0485  malate dehydrogenase  69.33 
 
 		 328 aa  449  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0756  malate dehydrogenase  68.6 
 
 		 329 aa  447  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1065  malate dehydrogenase  68.6 
 
 		 329 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.686479  normal  0.0244585 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0550  malate dehydrogenase  68.71 
 
 		 328 aa  444  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2206  malate dehydrogenase  69.82 
 
 		 328 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0790  malate dehydrogenase  69.42 
 
 		 328 aa  438  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108388  normal  0.0782545 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1803  malate dehydrogenase  68.6 
 
 		 328 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0126909  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02545  malate dehydrogenase  69.72 
 
 		 328 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3063  malate dehydrogenase  67.79 
 
 		 327 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2791  malate dehydrogenase  69.51 
 
 		 350 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.179491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1432  malate dehydrogenase  67.99 
 
 		 328 aa  435  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4356  malate dehydrogenase  67.38 
 
 		 328 aa  435  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.253468 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2708  malate dehydrogenase  69.51 
 
 		 328 aa  436  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105677 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2281  malate dehydrogenase  68.9 
 
 		 328 aa  432  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3598  malate dehydrogenase  67.99 
 
 		 328 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2429  malate dehydrogenase  69.21 
 
 		 328 aa  431  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0460  malate dehydrogenase  66.16 
 
 		 329 aa  431  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0503945  normal  0.124945 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1829  malate dehydrogenase  65.85 
 
 		 328 aa  424  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.652638 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2153  malate dehydrogenase  65.85 
 
 		 328 aa  424  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.266134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2172  malate dehydrogenase  66.46 
 
 		 328 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1998  malate dehydrogenase  65.96 
 
 		 329 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.304993  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3030  malate dehydrogenase  66.46 
 
 		 328 aa  421  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392331  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2552  malate dehydrogenase  65.35 
 
 		 329 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112187  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0258  malate dehydrogenase  61.66 
 
 		 327 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0127351 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2867  malate dehydrogenase  64.26 
 
 		 328 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4642  malate dehydrogenase  62.58 
 
 		 328 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2669  malate dehydrogenase  61.66 
 
 		 327 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.493712  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1617  malate dehydrogenase  61.04 
 
 		 329 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.814638  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0978  malate dehydrogenase  61.11 
 
 		 329 aa  389  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0864  malate dehydrogenase  59.51 
 
 		 327 aa  390  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0830  malate dehydrogenase  60.62 
 
 		 326 aa  385  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.592408  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2161  malate dehydrogenase  63.99 
 
 		 334 aa  383  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.555081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1713  malate dehydrogenase  61.11 
 
 		 329 aa  378  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1659  malate dehydrogenase  60.92 
 
 		 327 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000634341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0487  malate dehydrogenase  58.77 
 
 		 326 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0092  malate dehydrogenase  58.9 
 
 		 330 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.021843  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4209  malate dehydrogenase  57.98 
 
 		 329 aa  368  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.432377  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6492  malate dehydrogenase  58.28 
 
 		 329 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156958  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19950  malate dehydrogenase  57.36 
 
 		 329 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000211978  hitchhiker  0.000178051 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1873  malate dehydrogenase  61.35 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0651277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2044  malate dehydrogenase  60.74 
 
 		 329 aa  366  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.375766 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1763  malate dehydrogenase  60.43 
 
 		 329 aa  363  2e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5280  malate dehydrogenase  59.69 
 
 		 331 aa  361  8e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2256  malate dehydrogenase  57.36 
 
 		 328 aa  359  3e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000133254  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0774  malate dehydrogenase  57.36 
 
 		 329 aa  358  5e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07840  malate dehydrogenase  56.31 
 
 		 342 aa  357  9.999999999999999e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.172278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2522  malate dehydrogenase  58.41 
 
 		 330 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0230761  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28070  malate dehydrogenase (NAD)  56.44 
 
 		 329 aa  352  7e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0979887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3441  malate dehydrogenase  55.21 
 
 		 329 aa  351  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3578  malate dehydrogenase  55.52 
 
 		 328 aa  348  6e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2659  malate dehydrogenase  57.63 
 
 		 325 aa  348  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7973  malate dehydrogenase  56.44 
 
 		 329 aa  346  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4268  malate dehydrogenase  56.62 
 
 		 325 aa  346  4e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0186905  normal  0.0169566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1259  malate dehydrogenase  55.69 
 
 		 325 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11265  malate dehydrogenase  54.6 
 
 		 329 aa  342  7e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000004944  decreased coverage  0.000678049 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2403  malate dehydrogenase  53.19 
 
 		 334 aa  341  9e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.433126  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3006  malate dehydrogenase  59.05 
 
 		 328 aa  337  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0610  malate dehydrogenase  54.77 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.18375  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3067  malate dehydrogenase  55.38 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.583103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3339  malate dehydrogenase  54.63 
 
 		 331 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0149092 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0688  malate dehydrogenase  53.61 
 
 		 327 aa  321  9.999999999999999e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1290  malate dehydrogenase  54.55 
 
 		 325 aa  314  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1133  malate dehydrogenase  52.28 
 
 		 329 aa  311  1e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.275779  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0743  malate dehydrogenase  52.01 
 
 		 328 aa  311  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00985263  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1384  malate dehydrogenase  50.31 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1436  malate dehydrogenase  50.61 
 
 		 329 aa  300  2e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.756645 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1325  malate dehydrogenase  50 
 
 		 328 aa  299  5e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0597449  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00950  malate dehydrogenase  51.81 
 
 		 361 aa  293  2e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87414  predicted protein  48.73 
 
 		 335 aa  294  2e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2783  malate dehydrogenase  52.62 
 
 		 329 aa  293  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1880  malate dehydrogenase  49.85 
 
 		 329 aa  292  6e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0813  malate dehydrogenase  49.85 
 
 		 327 aa  291  7e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42336  predicted protein  46.34 
 
 		 430 aa  280  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22262  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2301  malate dehydrogenase  48.77 
 
 		 330 aa  278  8e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0511  malate dehydrogenase  52.6 
 
 		 329 aa  275  6e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2274  malate dehydrogenase  48.16 
 
 		 330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0655  malate dehydrogenase  47.08 
 
 		 326 aa  272  5.000000000000001e-72  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1949  malate dehydrogenase  31.82 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  28.92 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>