37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1493 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1493  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4597  cysteine dioxygenase type I  36.76 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.459567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4463  cysteine dioxygenase type I  36.76 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3216  hypothetical protein  37.43 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.460975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3618  cysteine dioxygenase type I  36.26 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.233874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2216  cysteine dioxygenase type I  35.03 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100364  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3875  cysteine dioxygenase type I  36.72 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2664  cysteine dioxygenase type I  37.63 
 
 		 207 aa  111  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000978077  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3544  cysteine dioxygenase type I  32.77 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.272534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5045  cysteine dioxygenase type I  35.96 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3576  cysteine dioxygenase type I  36.31 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30440  putative enzyme  33.33 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4331  cysteine dioxygenase type I  36.21 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.173506 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30970  cysteine dioxygenase type I protein  35.59 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2513  cysteine dioxygenase type I  33.87 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0862  hypothetical protein  35 
 
 		 188 aa  105  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1752  double-stranded beta helix superfamily protein  34.46 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188529  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1548  cysteine dioxygenase type I  35.29 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1793  hypothetical protein  34.68 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3683  cysteine dioxygenase type I  35.03 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4156  cysteine dioxygenase type I  34.46 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.793001  normal  0.481367 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4259  cysteine dioxygenase type I  33.9 
 
 		 188 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00114989  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4107  cysteine dioxygenase type I  33.9 
 
 		 188 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289142  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3258  cysteine dioxygenase type I  33.9 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1914  hypothetical protein  32.22 
 
 		 193 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3601  hypothetical protein  33.73 
 
 		 203 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5233  cysteine dioxygenase type I  32.77 
 
 		 198 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.220688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2159  hypothetical protein  35.91 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2674  cysteine dioxygenase type I  38.82 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1712  cysteine dioxygenase type I  35.4 
 
 		 194 aa  86.3  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1341  hypothetical protein  32.14 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0608  hypothetical protein  32.35 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5454  hypothetical protein  25.67 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1882  cysteine dioxygenase type I  24.38 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0884885  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5442  cysteine dioxygenase type I  26.43 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2378  hypothetical protein  27.87 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2507  cysteine dioxygenase type I  27.5 
 
 		 192 aa  42.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0215877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>