More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0679 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0679  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
95 aa  186  9e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0812265  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0610  50S ribosomal protein L23  51.58 
 
 
96 aa  94.4  4e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0411  50S ribosomal protein L23  48.42 
 
 
96 aa  84  7e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.727367  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1793  50S ribosomal protein L23  33.7 
 
 
98 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346044  normal  0.0641385 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  39.56 
 
 
98 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  35.96 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  34.48 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0278  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  37.08 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  36.56 
 
 
97 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  39.56 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  35.48 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 
99 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  35.48 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  35.48 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0758  50S ribosomal protein L23  35.23 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156644  normal  0.0173378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  36.56 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  36.56 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  34.41 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0585  50S ribosomal protein L23  35.87 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.720688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  35.87 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  36.96 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  39.33 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  40 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2255  50S ribosomal protein L23  37.36 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000014312  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  36.96 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0700  50S ribosomal protein L23  35.16 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000143862  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0668  50S ribosomal protein L23  35.16 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142276  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  35.48 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  35.87 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  34.83 
 
 
101 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  37.08 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  34.78 
 
 
103 aa  62  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1681  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 
102 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0570438  hitchhiker  0.0000115816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 
98 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  33.7 
 
 
99 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  34.83 
 
 
100 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0340  50S ribosomal protein L23  33.72 
 
 
104 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00586276  hitchhiker  0.000885961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  37.08 
 
 
100 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  36.96 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0297  ribosomal L23 protein  36.14 
 
 
98 aa  60.8  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000230523  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0662  50S ribosomal protein L23  34.07 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  34.78 
 
 
99 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0761  50S ribosomal protein L23  38.46 
 
 
98 aa  60.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679128  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  35.63 
 
 
95 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0393  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000842978  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0321  50S ribosomal protein L23  33.72 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.11411e-18  hitchhiker  0.000000647477 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0435  50S ribosomal protein L23  35.96 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00486251  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2322  ribosomal L23 protein  31.18 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0856  50S ribosomal protein L23  30.34 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483725  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  30.68 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  38.71 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  38.89 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0496  50S ribosomal protein L23  34.83 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000003402  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  36.67 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  37.5 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  34.09 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2772  50S ribosomal protein L23  37.04 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0118683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  31.46 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0849  50S ribosomal protein L23P  35.63 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000828313  decreased coverage  0.0000112275 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0275  50S ribosomal protein L23  33.72 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000521502  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0280  50S ribosomal protein L23  33.72 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00123621  hitchhiker  0.00000000748159 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  35.23 
 
 
100 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108369  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  36.36 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  35.23 
 
 
100 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000248684  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  35.23 
 
 
100 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  36.59 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  36.59 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4542  50S ribosomal protein L23  34.09 
 
 
100 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172317  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3997  50S ribosomal protein L23  36.05 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000137329 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  32.63 
 
 
94 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0205  50S ribosomal protein L23  33.72 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  42.39 
 
 
101 aa  57  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  35.37 
 
 
91 aa  57  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4911  50S ribosomal protein L23  30.68 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000771327  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  35.96 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0081  50S ribosomal protein L23  36.67 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  37.93 
 
 
94 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0395  Ribosomal protein L25/L23  34.12 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000225919  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3805  50S ribosomal protein L23  34.12 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000686351  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3703  50S ribosomal protein L23  34.12 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225733  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3742  50S ribosomal protein L23  34.12 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.344368  normal  0.0150111 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3613  50S ribosomal protein L23  34.12 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000847098  hitchhiker  0.00309782 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3707  50S ribosomal protein L23  34.12 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000802937  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3749  50S ribosomal protein L23  34.12 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000048697  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  36.67 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3793  50S ribosomal protein L23  32.56 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0844484  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  36.36 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  32.97 
 
 
102 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4641  50S ribosomal protein L23  34.12 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287124  normal  0.0460173 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3634  50S ribosomal protein L23  34.12 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000793915  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0471  50S ribosomal protein L23  34.12 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000395002  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0061  50S ribosomal protein L23  35.29 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000105028  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03120  hypothetical protein  34.12 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000565358  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3634  50S ribosomal protein L23  34.12 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00980054  normal  0.223242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>