94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0056 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0056  major facilitator family transporter  100 
 
 
395 aa  782    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0251  major facilitator family transporter  37.09 
 
 
401 aa  232  9e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.823307  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0838  hypothetical protein  35.91 
 
 
405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.0062417  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  23.33 
 
 
426 aa  82  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  23.88 
 
 
439 aa  79.7  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  23.58 
 
 
384 aa  79  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  20.36 
 
 
443 aa  79  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  21.13 
 
 
443 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  22.52 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  21.12 
 
 
432 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  20.7 
 
 
432 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  22.52 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  21.76 
 
 
430 aa  74.3  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  21.76 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  20.42 
 
 
430 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  20.42 
 
 
430 aa  70.5  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  21.62 
 
 
434 aa  70.5  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  19.71 
 
 
443 aa  69.7  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  20.65 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  20.65 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  22.11 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  21.2 
 
 
427 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  21.35 
 
 
432 aa  67  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  22.94 
 
 
437 aa  67  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  22.11 
 
 
428 aa  67  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373012  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  20.96 
 
 
422 aa  66.2  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  20.11 
 
 
426 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  22.87 
 
 
437 aa  63.5  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  18.55 
 
 
426 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  21.41 
 
 
445 aa  60.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1416  hypothetical protein  23.12 
 
 
429 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 
421 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  20.53 
 
 
428 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  23.96 
 
 
452 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  19.83 
 
 
451 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  20.53 
 
 
428 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  23.96 
 
 
452 aa  58.2  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  20.53 
 
 
441 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  21.9 
 
 
392 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 
413 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2985  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 
424 aa  53.1  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.124537 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  21.67 
 
 
418 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  24.2 
 
 
413 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  25.35 
 
 
406 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3390  major facilitator transporter  20.88 
 
 
441 aa  50.8  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205753 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  24.33 
 
 
434 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2287  multidrug resistance protein D  22.03 
 
 
408 aa  50.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.754315  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  20.14 
 
 
432 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  25.13 
 
 
415 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  20.88 
 
 
395 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  19.55 
 
 
434 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  18.44 
 
 
446 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  18.44 
 
 
446 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  17.52 
 
 
423 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  23.67 
 
 
434 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  23.79 
 
 
405 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  22.03 
 
 
432 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  19.48 
 
 
417 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01910  arabinose efflux permease family protein  26.05 
 
 
435 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0692  hypothetical protein  19.31 
 
 
427 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  20.19 
 
 
431 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  26.72 
 
 
428 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0675  hypothetical protein  19.31 
 
 
427 aa  46.6  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  18.69 
 
 
420 aa  46.6  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  18.69 
 
 
420 aa  46.6  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  21.16 
 
 
436 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  23.08 
 
 
425 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  22.55 
 
 
412 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 
413 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  21.91 
 
 
437 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  17.76 
 
 
423 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  19.29 
 
 
431 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  24.43 
 
 
420 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  21.1 
 
 
407 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  25 
 
 
436 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  22.76 
 
 
418 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  20.64 
 
 
446 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  19.3 
 
 
432 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  22.27 
 
 
431 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  20 
 
 
415 aa  43.9  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  21.33 
 
 
412 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  21.33 
 
 
412 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  21.33 
 
 
430 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  21.01 
 
 
389 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  21.01 
 
 
389 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  23.71 
 
 
411 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  21.33 
 
 
412 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  21.33 
 
 
412 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  21.33 
 
 
412 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  20.71 
 
 
389 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.9 
 
 
400 aa  43.1  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4758  major facilitator transporter  23.48 
 
 
417 aa  43.1  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0130699 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  21.33 
 
 
430 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  20.91 
 
 
450 aa  42.7  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>