More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0021 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0021  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 217 aa  431  1e-120  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0508427  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0955  50S ribosomal protein L1  62.5 
 
 		 220 aa  259  2e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0166  50S ribosomal protein L1  60.5 
 
 		 220 aa  257  1e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0395  50S ribosomal protein L1P  51.5 
 
 		 231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.00704539 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0595  50S ribosomal protein L1  48.79 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00100936  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2869  50S ribosomal protein L1  50.79 
 
 		 234 aa  201  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000234009  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  47.5 
 
 		 232 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4286  50S ribosomal protein L1  47.52 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185505  hitchhiker  0.000000513776 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3348  50S ribosomal protein L1  49.5 
 
 		 232 aa  200  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.728506  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002170  LSU ribosomal protein L1p (L10Ae)  51.32 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000179792  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00228  50S ribosomal protein L1  51.32 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  47.5 
 
 		 232 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0238  50S ribosomal protein L1  47 
 
 		 232 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629603  normal  0.0137855 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  46.53 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0324  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  47.26 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1865  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000283442  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  47.26 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  47 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00693  ribosomal protein L1  48.47 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000527661  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  47 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  47 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0709  50S ribosomal protein L1  50.26 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146158  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2970  50S ribosomal protein L1  48.26 
 
 		 231 aa  198  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4556  50S ribosomal protein L1  52.91 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103924  decreased coverage  0.00000000000032652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4392  50S ribosomal protein L1  52.91 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168999  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4482  50S ribosomal protein L1  52.91 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  decreased coverage  0.0000000000000063048 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4479  50S ribosomal protein L1  52.91 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0614276  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4360  50S ribosomal protein L1  52.91 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0197515  normal  0.388445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3317  50S ribosomal protein L1  48.26 
 
 		 231 aa  198  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.809364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3181  50S ribosomal protein L1  46.5 
 
 		 232 aa  197  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145836  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2644  50S ribosomal protein L1  46.5 
 
 		 232 aa  197  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  46.5 
 
 		 232 aa  197  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  46.5 
 
 		 232 aa  197  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3466  50S ribosomal protein L1  46.5 
 
 		 232 aa  197  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0147067  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  46.5 
 
 		 232 aa  197  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3079  50S ribosomal protein L1  46.5 
 
 		 232 aa  197  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1911  50S ribosomal protein L1  46.5 
 
 		 232 aa  197  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299291  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3734  ribosomal protein L1  51.49 
 
 		 234 aa  197  7.999999999999999e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  46.04 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3037  50S ribosomal protein L1  47.76 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  48.04 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0170  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000255215  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27781  50S ribosomal protein L1  44.12 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0274  50S ribosomal protein L1  51.55 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655427  normal  0.0476273 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03860  50S ribosomal protein L1  50.99 
 
 		 234 aa  194  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000865195  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4011  ribosomal protein L1  50.99 
 
 		 234 aa  195  6e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271875  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4432  50S ribosomal protein L1  50.99 
 
 		 234 aa  194  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000639921  hitchhiker  0.0000029085 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4041  50S ribosomal protein L1  50.99 
 
 		 234 aa  194  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000597884  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5449  50S ribosomal protein L1  50.99 
 
 		 234 aa  194  6e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000118396  hitchhiker  0.00123384 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03813  hypothetical protein  50.99 
 
 		 234 aa  194  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000121828  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4472  50S ribosomal protein L1  50.99 
 
 		 234 aa  194  6e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362466  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4524  50S ribosomal protein L1  50.99 
 
 		 234 aa  194  6e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100001  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4217  50S ribosomal protein L1  50.99 
 
 		 234 aa  194  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.26604e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  48.5 
 
 		 235 aa  194  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  47.76 
 
 		 232 aa  194  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0499  50S ribosomal protein L1  46.08 
 
 		 234 aa  194  8.000000000000001e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0194  50S ribosomal protein L1  51.85 
 
 		 234 aa  194  8.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000443465  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  48.97 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  47.06 
 
 		 231 aa  193  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3888  ribosomal protein L1  49.76 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  47.72 
 
 		 233 aa  193  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3863  50S ribosomal protein L1  49.28 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298725  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  48.7 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  47.45 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0336  50S ribosomal protein L1  49.28 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00681469  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0868  ribosomal protein L1  46.31 
 
 		 231 aa  192  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  47.45 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  47.45 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2807  50S ribosomal protein L1  49.28 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532362  normal  0.121475 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4772  50S ribosomal protein L1  49.21 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0687152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  47.06 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  43.14 
 
 		 241 aa  191  6e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2179  ribosomal protein L1  48.97 
 
 		 231 aa  191  6e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.965533 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3870  ribosomal protein L1  48.47 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0633  50S ribosomal protein L1  45.1 
 
 		 237 aa  191  8e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.846201 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  44.98 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0202  50S ribosomal protein L1  50.99 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0394822  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2727  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000405483  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02211  50S ribosomal protein L1  44.08 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.54632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2334  ribosomal protein L1  47.03 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000592022  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  47.26 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  44.55 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  44.78 
 
 		 233 aa  188  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  47.96 
 
 		 233 aa  188  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2470  50S ribosomal protein L1  42.86 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.538849  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  46.38 
 
 		 242 aa  188  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  45.05 
 
 		 231 aa  188  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02321  50S ribosomal protein L1  45.81 
 
 		 235 aa  188  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  44.78 
 
 		 229 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  47.52 
 
 		 231 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  48.26 
 
 		 231 aa  187  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0203  50S ribosomal protein L1  51.32 
 
 		 233 aa  187  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000988854  hitchhiker  0.00010102 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  47.06 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  48.98 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1570  50S ribosomal protein L1  43.63 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0269  50S ribosomal protein L1  49.25 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0927887  hitchhiker  0.00154879 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02791  50S ribosomal protein L1  43.63 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.475982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0230  50S ribosomal protein L1  48.94 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.365606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  49.48 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>