More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0014 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0014  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 124 aa  247  5e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0159  30S ribosomal protein S12  83.06 
 
 		 123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000153549  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0963  30S ribosomal protein S12  82.26 
 
 		 123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  77.05 
 
 		 137 aa  187  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1115  ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 124 aa  186  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 122 aa  185  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3166  30S ribosomal protein S12  74.59 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.935823 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4320  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3928  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.418026  normal  0.366347 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  74.59 
 
 		 123 aa  185  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  75.41 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3469  ribosomal protein S12  74.59 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329977  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0045  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 126 aa  184  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000913228  hitchhiker  7.76086e-21 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  76.23 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  74.59 
 
 		 123 aa  184  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1358  30S ribosomal protein S12  72.95 
 
 		 123 aa  184  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179796  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1012  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 124 aa  184  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  75.41 
 
 		 124 aa  184  4e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0984  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 124 aa  184  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1002  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 124 aa  184  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  73.77 
 
 		 123 aa  184  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  73.77 
 
 		 123 aa  184  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  74.59 
 
 		 137 aa  183  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  183  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1244  30S ribosomal protein S12  71.31 
 
 		 123 aa  183  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349862  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  76.23 
 
 		 123 aa  183  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5119  ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  183  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2651  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  183  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5078  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  183  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.621439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1279  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  183  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1833  30S ribosomal protein S12  72.95 
 
 		 202 aa  183  9e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0567288  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  74.59 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1426  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0159812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  74.59 
 
 		 124 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0622  ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 124 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1929  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2823  30S ribosomal protein S12  71.31 
 
 		 123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0494947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2014  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0048  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042248  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1951  30S ribosomal protein S12  72.95 
 
 		 123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000165732  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  72.95 
 
 		 123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  72.95 
 
 		 125 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_004310  BR1238  30S ribosomal protein S12  72.95 
 
 		 123 aa  181  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1259  30S ribosomal protein S12  72.95 
 
 		 125 aa  181  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  71.54 
 
 		 126 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 124 aa  181  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  71.54 
 
 		 126 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  73.77 
 
 		 123 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  73.77 
 
 		 124 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1201  30S ribosomal protein S12  72.95 
 
 		 123 aa  181  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.449722  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3806  ribosomal protein S12  73.77 
 
 		 123 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.800192  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10696  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 126 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  71.54 
 
 		 126 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  71.54 
 
 		 126 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2695  30S ribosomal protein S12  75.21 
 
 		 124 aa  181  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.281072 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0981  30S ribosomal protein S12  72.95 
 
 		 123 aa  181  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.808535  normal  0.0659851 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  72.13 
 
 		 123 aa  181  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 124 aa  181  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 124 aa  181  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2982  30S ribosomal protein S12  75.21 
 
 		 124 aa  181  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80538  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3185  30S ribosomal protein S12  73.77 
 
 		 125 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0661629  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  72.13 
 
 		 125 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
NC_012850  Rleg_1425  30S ribosomal protein S12  72.95 
 
 		 123 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469141  normal  0.0235591 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1327  30S ribosomal protein S12  72.95 
 
 		 123 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139307  normal  0.0632073 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3302  30S ribosomal protein S12  73.77 
 
 		 125 aa  180  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000119116  hitchhiker  0.00857233 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3024  30S ribosomal protein S12  73.77 
 
 		 125 aa  180  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000203236  decreased coverage  0.00243586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2955  30S ribosomal protein S12  73.77 
 
 		 125 aa  180  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0353473  hitchhiker  0.000186229 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2234  30S ribosomal protein S12  73.77 
 
 		 135 aa  180  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000995166  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  72.95 
 
 		 128 aa  180  5.0000000000000004e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0268  30S ribosomal protein S12  72.95 
 
 		 125 aa  180  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000012453  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  73.77 
 
 		 135 aa  180  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0273  30S ribosomal protein S12  72.95 
 
 		 125 aa  180  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0102222  hitchhiker  0.00000133028 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3148  ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 124 aa  180  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 124 aa  180  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  73.77 
 
 		 129 aa  180  7e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17230  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 124 aa  180  7e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0921  30S ribosomal protein S12  73.77 
 
 		 124 aa  180  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  72.95 
 
 		 128 aa  180  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  72.95 
 
 		 123 aa  180  7e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  72.95 
 
 		 135 aa  179  8.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  72.95 
 
 		 124 aa  179  8.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1606  ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 126 aa  179  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.524218 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3327  30S ribosomal protein S12  72.95 
 
 		 125 aa  179  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>