49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1780 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1780  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  332  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.666147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1097  extracellular solute-binding protein  53.93 
 
 		 416 aa  89.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000486653  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3689  extracellular solute-binding protein  53.01 
 
 		 416 aa  84  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  50.59 
 
 		 417 aa  81.6  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1695  extracellular solute-binding protein  50.57 
 
 		 420 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.157617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4349  extracellular solute-binding protein  48.89 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000381076  hitchhiker  0.000997313 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2416  extracellular solute-binding protein  51.72 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.230559  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0523  extracellular solute-binding protein  44.74 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1113  extracellular solute-binding protein  46.05 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1292  glucose ABC transporter, periplasmic glucose-binding protein, putative  44.74 
 
 		 428 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.927491  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0083  extracellular solute-binding protein family 1  44.94 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  46.43 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  46.43 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1150  extracellular solute-binding protein  45.88 
 
 		 417 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0392592  normal  0.752071 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  40.51 
 
 		 425 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4370  extracellular solute-binding protein  42.68 
 
 		 433 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3404  extracellular solute-binding protein  39.47 
 
 		 413 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4209  extracellular solute-binding protein  43.42 
 
 		 428 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1053  extracellular solute-binding protein  43.42 
 
 		 428 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00219882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1015  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  44.44 
 
 		 428 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1013  extracellular solute-binding protein  43.24 
 
 		 428 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3935  extracellular solute-binding protein  35.96 
 
 		 420 aa  48.1  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0774395  normal  0.611638 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0628  extracellular solute-binding protein  40.22 
 
 		 415 aa  48.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3086  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  40.26 
 
 		 415 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  40.26 
 
 		 415 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3052  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  40.26 
 
 		 415 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  40.26 
 
 		 415 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2615  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  40.26 
 
 		 415 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.813067  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2129  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  40.26 
 
 		 415 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0782  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  40.26 
 
 		 415 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1553  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  40.26 
 
 		 415 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0365178  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0860  extracellular solute-binding protein family 1  40.23 
 
 		 415 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0321479  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0840  extracellular solute-binding protein  38.96 
 
 		 415 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0929  extracellular solute-binding protein  38.96 
 
 		 415 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0968  extracellular solute-binding protein  38.96 
 
 		 415 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278189  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0828  extracellular solute-binding protein  38.96 
 
 		 415 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00532301  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0489  extracellular solute-binding protein  38.96 
 
 		 415 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0816838  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3451  ABC sugar (maltose) transporter, periplasmic ligand binding protein  42.03 
 
 		 415 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1028  extracellular solute-binding protein family 1  42.03 
 
 		 415 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00732462  normal  0.0899654 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4071  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  38.96 
 
 		 415 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00185695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2284  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  44 
 
 		 410 aa  45.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.61221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2430  extracellular solute-binding protein  38.96 
 
 		 415 aa  45.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682399  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0693  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  36.36 
 
 		 421 aa  45.1  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0998966  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2191  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  39.29 
 
 		 415 aa  45.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537651  hitchhiker  0.00669154 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6328  extracellular solute-binding protein  40.54 
 
 		 415 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3170  extracellular solute-binding protein  35.44 
 
 		 414 aa  44.7  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3817  extracellular solute-binding protein  32.53 
 
 		 421 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284829  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29280  sugar ABC transport system, periplasmic substrate-binding protein  30.14 
 
 		 388 aa  42.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3573  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 		 414 aa  41.2  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>