90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0554 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0554  ABC-type transport system ipermease component  100 
 
 		 287 aa  555  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1216  protein of unknown function DUF140  75.29 
 
 		 269 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2592  ABC-type transport system ipermease component  75.29 
 
 		 269 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338315  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1817  ABC-type transport system ipermease component  69.35 
 
 		 266 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.677101  normal  0.663369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2917  ABC-type transport system ipermease component  65.76 
 
 		 267 aa  312  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.68083  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2659  ABC-type transport system ipermease component  64.71 
 
 		 267 aa  289  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1789  ABC-type transport system ipermease component  59.61 
 
 		 267 aa  289  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.047158 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0012  ABC-type transport system ipermease component  57.43 
 
 		 249 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1224  ABC-type transport system ipermease component  54.25 
 
 		 266 aa  228  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0980  ABC-type transport system ipermease component  37.55 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0674411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  28.75 
 
 		 382 aa  52.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  29.69 
 
 		 382 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1965  protein of unknown function DUF140  30.32 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  28.91 
 
 		 378 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  28.91 
 
 		 378 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  29.15 
 
 		 265 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  28.64 
 
 		 265 aa  49.3  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  29.17 
 
 		 375 aa  48.9  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3100  hypothetical protein  29.82 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.496882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  28.91 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  34.48 
 
 		 378 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  28.72 
 
 		 265 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  29.69 
 
 		 388 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  32.08 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  23.12 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  29.3 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  32.08 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  25.31 
 
 		 377 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1014  hypothetical protein  31.41 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  25.31 
 
 		 377 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  27.12 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  29.3 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  29.77 
 
 		 269 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5535  hypothetical protein  32.3 
 
 		 260 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  30.83 
 
 		 328 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  31.85 
 
 		 255 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  31.85 
 
 		 255 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  31.85 
 
 		 255 aa  46.2  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  31.21 
 
 		 255 aa  45.8  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  27.48 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  27.48 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  29.49 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  31.21 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  25.58 
 
 		 365 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  28.09 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  31.25 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  30.57 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2398  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3649  protein of unknown function DUF140  28.21 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  26.38 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  30.57 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  32.95 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3388  protein of unknown function DUF140  26.4 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159467 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  31.96 
 
 		 368 aa  43.9  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3790  protein of unknown function DUF140  25.95 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3734  toluene tolerance ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1778  ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  26.79 
 
 		 377 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3003  ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  32.95 
 
 		 260 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3229  ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387894  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3676  toluene tolerance ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0296584  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3703  ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2775  ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2725  ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  30.77 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  25.32 
 
 		 393 aa  43.5  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  30 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0958  hypothetical protein  28.46 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1030  hypothetical protein  26.45 
 
 		 229 aa  43.5  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  29.11 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0980  hypothetical protein  26.64 
 
 		 261 aa  43.1  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  26.86 
 
 		 370 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  27.62 
 
 		 368 aa  43.1  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  31.37 
 
 		 255 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0794  hypothetical protein  36.56 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0717  protein of unknown function DUF140  31.16 
 
 		 260 aa  43.1  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  31.37 
 
 		 255 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0749  hypothetical protein  31.16 
 
 		 260 aa  43.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  29.11 
 
 		 265 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  24.5 
 
 		 344 aa  42.7  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  29 
 
 		 265 aa  42.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  28.06 
 
 		 265 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  30.13 
 
 		 260 aa  42.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  31.11 
 
 		 377 aa  42.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0388  ABC transporter inner membrane protein  34.09 
 
 		 255 aa  42.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  23.81 
 
 		 368 aa  42.4  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  29.29 
 
 		 266 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0760  protein of unknown function DUF140  34.27 
 
 		 266 aa  42.4  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  27.05 
 
 		 258 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>