More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5572 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5572  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 340 aa  692    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00642792  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2759  glycosyl transferase family protein  52.35 
 
 		 362 aa  358  9e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0771  glycosyl transferase family protein  52.6 
 
 		 339 aa  325  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417869  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  48.23 
 
 		 319 aa  322  7e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1377  glycosyl transferase family protein  49.33 
 
 		 323 aa  320  3e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0520964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1526  glycosyl transferase family 2  54.82 
 
 		 334 aa  315  9e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0599  glycosyl transferase family protein  52.01 
 
 		 343 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  46.3 
 
 		 319 aa  312  5.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0561  glycosyl transferase family protein  50.33 
 
 		 334 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  47.08 
 
 		 350 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  44.48 
 
 		 335 aa  282  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  44.12 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  43.79 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  44.48 
 
 		 332 aa  275  6e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  46.58 
 
 		 340 aa  275  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  46.75 
 
 		 357 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1485  polyprenyl-phosphate beta-D-glucosyltransferase  41.78 
 
 		 324 aa  272  5.000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.376864  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  43.65 
 
 		 334 aa  272  6e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  46.23 
 
 		 338 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  45.71 
 
 		 358 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  45.21 
 
 		 320 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0692  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.45 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58802  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.9 
 
 		 353 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.9 
 
 		 353 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.9 
 
 		 353 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  47.4 
 
 		 367 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  44.79 
 
 		 365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  45.4 
 
 		 358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  44.79 
 
 		 365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  44.92 
 
 		 359 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6381  glycosyl transferase family protein  46.36 
 
 		 347 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35625  normal  0.721648 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5508  glycosyl transferase family protein  46.36 
 
 		 347 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465095  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5872  glycosyl transferase family protein  46.36 
 
 		 347 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146169  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  42.44 
 
 		 319 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  44.48 
 
 		 365 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4719  glycosyl transferase family protein  45.81 
 
 		 346 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.19129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  45.25 
 
 		 353 aa  264  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  46.43 
 
 		 339 aa  263  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  44.09 
 
 		 347 aa  263  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  45.9 
 
 		 339 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  40.68 
 
 		 346 aa  262  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7210  glycosyl transferase family protein  45.57 
 
 		 348 aa  262  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  46.03 
 
 		 347 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  46.03 
 
 		 347 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  47.33 
 
 		 373 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  47.33 
 
 		 373 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  45.9 
 
 		 337 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2352  glycosyl transferase family protein  44.81 
 
 		 363 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0302049  normal  0.854444 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  44.74 
 
 		 319 aa  259  6e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  41.75 
 
 		 333 aa  255  8e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  41.5 
 
 		 343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  40.84 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3637  glycosyl transferase family 2  45.31 
 
 		 336 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1339  glycosyl transferase family 2  42.72 
 
 		 347 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  42.27 
 
 		 364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  44.3 
 
 		 335 aa  252  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  40.23 
 
 		 366 aa  252  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1679  glycosyl transferase family protein  42.9 
 
 		 347 aa  252  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1389  glycosyl transferase  38.59 
 
 		 333 aa  251  8.000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.776961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  41.64 
 
 		 339 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  44.55 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  42.43 
 
 		 311 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  47.99 
 
 		 334 aa  250  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  42.43 
 
 		 311 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  43.93 
 
 		 348 aa  249  4e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  38.91 
 
 		 320 aa  248  9e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  40.44 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  41.07 
 
 		 340 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  39.5 
 
 		 356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  40.59 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  40.07 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.01 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  36.01 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  35.69 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  36.01 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.01 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  39.74 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  42.52 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1844  glycosyl transferase family protein  42.72 
 
 		 347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000858357 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  39.74 
 
 		 308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  39.93 
 
 		 306 aa  242  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  39.87 
 
 		 341 aa  242  9e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  40.86 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163631 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  40.26 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  39.93 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2567  glycosyl transferase family protein  43.16 
 
 		 348 aa  241  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  36.3 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  40.13 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.01126 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1307  Ribonuclease III  39.74 
 
 		 306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00145921  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4119  glycosyl transferase family protein  43.09 
 
 		 347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.527545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  41.08 
 
 		 322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  39.69 
 
 		 330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  37.58 
 
 		 320 aa  239  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3189  glycosyl transferase family protein  43.65 
 
 		 348 aa  238  9e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  40.51 
 
 		 360 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  41.81 
 
 		 345 aa  237  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  39.81 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  34.87 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  40.76 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  37.75 
 
 		 319 aa  236  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>