18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2852 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2852  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 126 aa  263  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2333  hypothetical protein  60.68 
 
 		 125 aa  167  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607058  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3019  hypothetical protein  56.67 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122791 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3702  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.14 
 
 		 120 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2282  hypothetical protein  43.55 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3430  hypothetical protein  41.23 
 
 		 122 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6212  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.8 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0947476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1637  cupin 2 domain-containing protein  43.8 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.316087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2641  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.75 
 
 		 123 aa  107  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.17261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1290  hypothetical protein  40.68 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00531364  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3001  hypothetical protein  44.44 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00623326  decreased coverage  0.0000358597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0500  hypothetical protein  41.18 
 
 		 126 aa  103  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0528  hypothetical protein  43.48 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0331265  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1363  cupin 2 domain-containing protein  43.36 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1574  hypothetical protein  43.43 
 
 		 120 aa  97.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2431  hypothetical protein  40.35 
 
 		 239 aa  97.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0800028  normal  0.133087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2480  hypothetical protein  40.62 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.289333 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18632  predicted protein  36.27 
 
 		 267 aa  62  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  unclonable  0.000481195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>