185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2231 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2231  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 		 202 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0025  Glutathione S-transferase domain protein  68 
 
 		 204 aa  270  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2363  hypothetical protein  66.67 
 
 		 211 aa  267  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0713613  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2587  hypothetical protein  67.33 
 
 		 202 aa  267  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0030  Glutathione S-transferase domain  68 
 
 		 204 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3555  glutathione S-transferase-like  66.34 
 
 		 212 aa  264  8e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0580476  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0129  hypothetical protein  67.5 
 
 		 202 aa  260  8e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0989  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.87 
 
 		 202 aa  252  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0668  Glutathione S-transferase domain  57.35 
 
 		 204 aa  224  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1498  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.22 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3329  glutathione S-transferase-like protein  53.5 
 
 		 201 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14290  hypothetical protein  55.67 
 
 		 203 aa  218  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.128982  normal  0.822767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4031  putative glutathione S-transferase  55.39 
 
 		 204 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.658089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1267  hypothetical protein  54.68 
 
 		 203 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0405  hypothetical protein  61.35 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.631465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1595  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.07 
 
 		 209 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2794  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.59 
 
 		 209 aa  205  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149996  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1461  glutathione S-transferase  55.07 
 
 		 209 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1491  glutathione S-transferase family protein  55.07 
 
 		 209 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1169  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.07 
 
 		 209 aa  204  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00510554  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1157  glutathione S-transferase-like protein  54.59 
 
 		 209 aa  201  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4422  glutathione S-transferase-like protein  53.62 
 
 		 209 aa  201  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.178474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0798  glutathione S-transferase-like  54.11 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.762924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1279  glutathione S-transferase-like protein  54.11 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0111795  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1251  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.62 
 
 		 209 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119917 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0987  glutathione S-transferase-like protein  56.1 
 
 		 204 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7065  putative glutathione transferase  39.3 
 
 		 218 aa  121  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2272  Glutathione S-transferase-like protein  37.25 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0372  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.68 
 
 		 211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360497  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1395  glutathione S-transferase like protein  35.68 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00727348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0759  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.97 
 
 		 129 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1269  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.97 
 
 		 129 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0366351  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0601  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.97 
 
 		 129 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178944  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0552  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.97 
 
 		 129 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1266  glutathione S-transferase  64.86 
 
 		 78 aa  97.8  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00947497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0604  GST-like protein  64.86 
 
 		 78 aa  97.8  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.899714  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2242  glutathione S-transferase-like protein  33.33 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.025244  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2782  glutathione S-transferase-like protein  39.32 
 
 		 142 aa  85.5  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.724853  normal  0.967961 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  29.7 
 
 		 202 aa  84.7  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2584  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.21 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0702  glutathione S-transferase family protein  35.34 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0693  glutathione S-transferase family protein  35.34 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3647  Glutathione S-transferase domain  30.24 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0997379 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1878  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.76 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277157 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  27.09 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2729  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.3 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3758  Glutathione S-transferase domain  29.95 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1089  Glutathione S-transferase domain  27.64 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.600559  hitchhiker  0.000151531 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1562  glutathione S-transferase related protein  27.85 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.572147  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0226  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.01 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1795  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.11 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3449  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.8 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0572  hypothetical protein  31.63 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06120  hypothetical protein  31.63 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352199  decreased coverage  0.0055796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4868  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.5 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895586  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0089  putative glutathione S-transferase  29.38 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0363  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.3 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115928 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.94 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  26.11 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.18 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1835  Glutathione S-transferase domain protein  32.78 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.7 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1204  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.81 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1397  glutathione S-transferase  36.11 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  25.98 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0171  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.3 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  28.02 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3398  glutathione S-transferase  28.02 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0276  glutathione S-transferase  28.02 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1137  glutathione S-transferase  28.02 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3356  glutathione S-transferase family protein  28.02 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3392  glutathione S-transferase family protein  28.02 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  28.02 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  25.98 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  27.32 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.32 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0064  glutathione S-transferase  35.42 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.876217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.32 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5192  glutathione S-transferase-like protein  28.5 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355066  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  25.25 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2167  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.69 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.366461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  25.25 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  26.83 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0785  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.06 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.238617  normal  0.0753849 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  28.81 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2815  glutathione S-transferase-like  30.1 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.370194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0448  glutathione S-transferase, putative  26.63 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  24.14 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0360  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.79 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215038  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1545  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.47 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0116241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7162  Glutathione S-transferase domain protein  26.21 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4668  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.4 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0335  glutathione S-transferase family protein  28.28 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4727  glutathione S-transferase, putative  25.63 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.981894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0177  glutathione S-transferase family protein  26.24 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0356  Glutathione S-transferase domain  26.24 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  normal  0.746823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4913  Glutathione S-transferase domain  28.23 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.413564  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.74 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.09 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  27.05 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>