40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1328 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1328  protein of unknown function DUF1089  100 
 
 		 187 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0834165  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3663  hypothetical protein  42.93 
 
 		 184 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52498  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3413  hypothetical protein  39.13 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.331521 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4571  hypothetical protein  35.62 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3920  hypothetical protein  38.51 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0130172  normal  0.782299 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3511  hypothetical protein  36.65 
 
 		 194 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2070  hypothetical protein  38.89 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0397168  normal  0.75673 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4353  hypothetical protein  37.27 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605734  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4013  hypothetical protein  37.27 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4875  protein of unknown function DUF1089  34.39 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000355198  normal  0.582407 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1793  hypothetical protein  35.86 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0982203  hitchhiker  0.0000201517 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2515  hypothetical protein  33.15 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1333  hypothetical protein  32.79 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.349732  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1312  hypothetical protein  33.52 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0294  hypothetical protein  33.15 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0164483  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0568  hypothetical protein  33.9 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3366  hypothetical protein  36.3 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000501118  hitchhiker  0.0000000000000170165 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1260  hypothetical protein  32.96 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.928683  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38720  hypothetical protein  34.81 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1141  hypothetical protein  30.56 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.167433 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4072  hypothetical protein  30.05 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2999  hypothetical protein  35.4 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3300  hypothetical protein  34.07 
 
 		 187 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4530  hypothetical protein  29.51 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.16706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4123  protein of unknown function DUF1089  29.82 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4015  hypothetical protein  29.83 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.700649 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4678  hypothetical protein  28.49 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376007  normal  0.194539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3690  hypothetical protein  28.49 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5622  hypothetical protein  28.49 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0025  hypothetical protein  27.12 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2652  hypothetical protein  30 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1188  hypothetical protein  28.65 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0444931  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1479  hypothetical protein  29.89 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4603  protein of unknown function DUF1089  31.52 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1824  protein of unknown function DUF1089  35.29 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00397249  normal  0.0794049 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0307  protein of unknown function DUF1089  32.46 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3333  hypothetical protein  40.45 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0237179  normal  0.179396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3293  hypothetical protein  26.52 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13787  hypothetical protein  29.5 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4051  protein of unknown function DUF1089  28.08 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>