62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0882 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0882  putative esterase  100 
 
 		 323 aa  650    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6228  putative esterase  55.38 
 
 		 273 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.226912  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0696  putative esterase  31.65 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.665195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2868  cysteine synthase A  28.69 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.965819  normal  0.710891 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  26.98 
 
 		 640 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3719  putative esterase  27.13 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4495  putative esterase  33.81 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0827  putative esterase  29.75 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2707  putative esterase  25.2 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.427697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5261  putative esterase  29.84 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1097  putative esterase  28.24 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.808292 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2064  alpha/beta fold family hydrolase  34.72 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685345 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1666  putative esterase  26.09 
 
 		 445 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0598325  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0079  putative esterase  26.85 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4516  putative esterase  34.29 
 
 		 422 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0458  putative esterase  29.2 
 
 		 237 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0619  putative esterase  33.61 
 
 		 307 aa  53.9  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3111  putative esterase  29.67 
 
 		 312 aa  53.9  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.597643  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1594  putative esterase  32.65 
 
 		 409 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48746  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2741  putative esterase  31.03 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0471  putative esterase  30.86 
 
 		 339 aa  52.4  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  30.25 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2744  putative esterase  34.43 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000586392 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3395  alpha/beta fold family hydrolase  34.07 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.981621  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0079  hypothetical protein  25.38 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0868984  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2146  putative esterase  28.87 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3925  putative esterase  32.35 
 
 		 477 aa  50.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4375  putative esterase  27.54 
 
 		 288 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.649215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01445  putative esterase  28.37 
 
 		 381 aa  49.3  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.676403  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3277  putative esterase  33.33 
 
 		 273 aa  49.3  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.294344  normal  0.0259177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3791  putative esterase  26.51 
 
 		 262 aa  49.3  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2988  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  26.09 
 
 		 374 aa  49.3  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000107918 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1473  putative esterase  26.76 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1341  putative esterase  28.99 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2329  putative esterase  30.56 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3614  putative esterase  25.45 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4870  putative esterase  29.89 
 
 		 335 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533976  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1067  putative esterase  29.27 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.928127  normal  0.256453 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1038  putative esterase  29.27 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2349  putative esterase  33.09 
 
 		 460 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705233  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0711  putative esterase  25.77 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000350604  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0973  putative esterase  30.6 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2799  hypothetical protein  28.57 
 
 		 526 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1478  putative esterase  29.46 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.500131  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6036  putative esterase  32.37 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000538936  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4525  putative esterase  26.21 
 
 		 277 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0383068  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3040  putative esterase  24.38 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91008 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0676  putative esterase  45.45 
 
 		 79 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1407  putative esterase  25.79 
 
 		 640 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00376031  normal  0.509577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3542  putative esterase  30.7 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0209702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  27.27 
 
 		 708 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1112  putative esterase  26.55 
 
 		 409 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291043  normal  0.610364 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1251  putative esterase  25.89 
 
 		 341 aa  43.5  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32905  hypothetical protein  29.31 
 
 		 526 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.954654  hitchhiker  0.000184596 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1825  putative esterase  30.28 
 
 		 276 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal  0.167809 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  50 
 
 		 1281 aa  43.5  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3504  putative esterase  25 
 
 		 405 aa  43.9  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1518  putative esterase  29.63 
 
 		 442 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2307  putative esterase  31.21 
 
 		 439 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1644  putative esterase  27.81 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2088  putative esterase  27.63 
 
 		 366 aa  43.1  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2144  putative esterase  26.28 
 
 		 400 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536761  normal  0.363467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>