More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0019 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0019  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 424 aa  857    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00362252  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0025  glycosyl transferase family protein  49.87 
 
 		 424 aa  362  6e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.676454  normal  0.397236 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0143  membrane carboxypeptidase-like protein  42.42 
 
 		 444 aa  248  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00763873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2505  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  44.2 
 
 		 232 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3681  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  48.46 
 
 		 235 aa  113  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0867  penicillin-binding protein 1A  35.75 
 
 		 835 aa  113  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.371617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0539  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.51 
 
 		 230 aa  112  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2444  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  46.15 
 
 		 229 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000188115  normal  0.588429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  38.1 
 
 		 776 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2516  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  44.27 
 
 		 236 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387388  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  37.57 
 
 		 779 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0959  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  43.85 
 
 		 248 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.156707  normal  0.22819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  39.78 
 
 		 810 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  44.62 
 
 		 741 aa  109  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0231  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  43.75 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2978  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a)  43.85 
 
 		 849 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0269  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  38.6 
 
 		 230 aa  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202831  hitchhiker  0.000723227 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1624  1A family penicillin-binding protein  43.85 
 
 		 849 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521017  normal  0.641281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  37.02 
 
 		 796 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  41.73 
 
 		 648 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0540  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  41.48 
 
 		 240 aa  106  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3906  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  43.08 
 
 		 231 aa  106  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3657  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  44.76 
 
 		 240 aa  106  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  38.82 
 
 		 730 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2967  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  44.76 
 
 		 232 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2534  penicillin-binding protein 1A  44.09 
 
 		 854 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175244 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  41.86 
 
 		 768 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  38.82 
 
 		 763 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3418  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.74 
 
 		 240 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0781618  normal  0.116104 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0201  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  44.96 
 
 		 225 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1857  1A family penicillin-binding protein  43.08 
 
 		 849 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.874221 
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  41.73 
 
 		 718 aa  103  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1213  glycosyl transferase family 51  42.64 
 
 		 985 aa  103  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  37.06 
 
 		 770 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  40 
 
 		 625 aa  103  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  41.86 
 
 		 769 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  41.09 
 
 		 757 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  41.09 
 
 		 750 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2627  glycosyl transferase family 51  36.87 
 
 		 656 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.987259  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  42.52 
 
 		 724 aa  103  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2721  glycosyl transferase family 51  36.87 
 
 		 656 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  39.69 
 
 		 643 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  41.09 
 
 		 758 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1979  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  41.09 
 
 		 275 aa  103  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00123405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1041  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  44.19 
 
 		 431 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2529  glycosyl transferase family protein  38.78 
 
 		 637 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  40.31 
 
 		 759 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  41.73 
 
 		 724 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  41.09 
 
 		 759 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2621  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40 
 
 		 246 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  44.19 
 
 		 651 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  41.09 
 
 		 760 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  41.86 
 
 		 714 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  43.08 
 
 		 775 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0582  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  43.08 
 
 		 245 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257138 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3413  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.49 
 
 		 261 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0922  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.49 
 
 		 261 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1238  glycosyl transferase family protein  36.87 
 
 		 655 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368931  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  41.01 
 
 		 618 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0948  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.49 
 
 		 261 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0131  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  43.08 
 
 		 245 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.563678  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  40 
 
 		 833 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  45.22 
 
 		 723 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0614  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  43.08 
 
 		 245 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0956  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.49 
 
 		 261 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  40.56 
 
 		 712 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  42.31 
 
 		 728 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  41.54 
 
 		 714 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2771  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  42.31 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  30.71 
 
 		 649 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0539  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  42.31 
 
 		 245 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.593842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3696  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  42.31 
 
 		 245 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  42.64 
 
 		 658 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0466  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 		 273 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000321197  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0515  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  42.31 
 
 		 245 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3735  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  39.66 
 
 		 258 aa  100  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  44.27 
 
 		 720 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  40.77 
 
 		 654 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1388  glycosyl transferase family 51  33.52 
 
 		 759 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319404  normal  0.452017 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  45.69 
 
 		 750 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0895  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  39.88 
 
 		 280 aa  100  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  39.23 
 
 		 640 aa  99.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0170  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  34.07 
 
 		 303 aa  100  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3077  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  39.88 
 
 		 261 aa  100  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1171  penicillin-binding protein  40.31 
 
 		 840 aa  100  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0742026  normal  0.682279 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0858  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  39.88 
 
 		 261 aa  100  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  36.52 
 
 		 757 aa  99.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  43.75 
 
 		 790 aa  99.8  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2776  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  44.07 
 
 		 234 aa  99  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.371956 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1815  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  44.96 
 
 		 219 aa  99.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114997  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3061  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.49 
 
 		 261 aa  99  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.631033  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  39.16 
 
 		 720 aa  99  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3643  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  36.07 
 
 		 241 aa  99  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0834774  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  40.77 
 
 		 727 aa  99  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  41.09 
 
 		 718 aa  99.4  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1156  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  37.79 
 
 		 229 aa  99.4  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  42.31 
 
 		 732 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  40.77 
 
 		 727 aa  99  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3020  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  44.07 
 
 		 234 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.360765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3374  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  36.18 
 
 		 274 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.296733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>