268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0008 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0008  metallophosphoesterase  100 
 
 
415 aa  821    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0021  metallophosphoesterase  61.64 
 
 
388 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.713648 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1343  Ser/Thr protein phosphatase family protein  59.39 
 
 
401 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0326  Ser/Thr protein phosphatase family protein  59.39 
 
 
401 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0603  Ser/Thr protein phosphatase family protein  59.39 
 
 
401 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.058835  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1298  Ser/Thr protein phosphatase family protein  59.64 
 
 
401 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1226  Ser/Thr protein phosphatase family protein  59.64 
 
 
401 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0965  Ser/Thr protein phosphatase family protein  59.39 
 
 
401 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1508  Ser/Thr protein phosphatase family protein  57.69 
 
 
403 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0546038  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4575  metallophosphoesterase  55.21 
 
 
383 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.752572  hitchhiker  0.0000097324 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5078  metallophosphoesterase  55.81 
 
 
386 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0646047  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3826  metallophosphoesterase  55.38 
 
 
389 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2487  calcineurin-like phosphoesterase  61.72 
 
 
348 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3220  metallophosphoesterase  57.47 
 
 
380 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2954  metallophosphoesterase  54.78 
 
 
387 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3650  metallophosphoesterase  56.46 
 
 
381 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4717  metallophosphoesterase  56.46 
 
 
381 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0431381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4804  metallophosphoesterase  58.7 
 
 
387 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.286552  hitchhiker  0.000577159 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2543  metallophosphoesterase  54.01 
 
 
387 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.655745  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4110  metallophosphoesterase  55.21 
 
 
383 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5583  metallophosphoesterase  55.94 
 
 
381 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304867 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3065  metallophosphoesterase  57.29 
 
 
378 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0215942  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1855  Ser/Thr protein phosphatase  57.52 
 
 
387 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0307878 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3977  metallophosphoesterase  55.15 
 
 
382 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.771354  normal  0.0153953 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1059  metallophosphoesterase  53.83 
 
 
382 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768167  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6012  metallophosphoesterase  42.39 
 
 
397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0399  metallophosphoesterase  39.51 
 
 
402 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129216 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5048  metallophosphoesterase  47.04 
 
 
417 aa  224  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475104  hitchhiker  0.00471023 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4538  metallophosphoesterase  46.67 
 
 
416 aa  223  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.855736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2412  putative phosphoesterase  44.6 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51749  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4026  metallophosphoesterase  50.19 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4142  metallophosphoesterase  50 
 
 
400 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4168  metallophosphoesterase  50.19 
 
 
400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130977  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5653  metallophosphoesterase  48.04 
 
 
419 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9222  phosphohydrolase-like protein  47.37 
 
 
465 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1023  metallophosphoesterase  38.12 
 
 
401 aa  200  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2926  metallophosphoesterase  40.16 
 
 
387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000117671  hitchhiker  0.00000962114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4909  metallophosphoesterase  42.76 
 
 
388 aa  196  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.108141  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5813  metallophosphoesterase  42.48 
 
 
410 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558208  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3468  metallophosphoesterase  46.15 
 
 
439 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4151  metallophosphoesterase  41.64 
 
 
381 aa  190  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4868  metallophosphoesterase  45.52 
 
 
425 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.225896  normal  0.165863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5168  metallophosphoesterase  43.7 
 
 
398 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.0894329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4782  metallophosphoesterase  44.07 
 
 
391 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358179  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4868  metallophosphoesterase  44.07 
 
 
391 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0052  metallophosphoesterase  43.97 
 
 
441 aa  186  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3152  metallophosphoesterase  43.28 
 
 
391 aa  186  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1803  metallophosphoesterase  40.29 
 
 
378 aa  179  7e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.499109  normal  0.0107634 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3359  metallophosphoesterase  38.16 
 
 
385 aa  177  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1067  metallophosphoesterase  41.61 
 
 
353 aa  177  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37190  predicted phosphohydrolase  42.81 
 
 
428 aa  176  9e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0869389 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1127  metallophosphoesterase  41.3 
 
 
377 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2585  metallophosphoesterase  43.82 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.443842 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2246  metallophosphoesterase  36.69 
 
 
373 aa  172  9e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.778293  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1238  metallophosphoesterase  40.94 
 
 
377 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0572  metallophosphoesterase  35.93 
 
 
376 aa  168  1e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0553  metallophosphoesterase  40.85 
 
 
373 aa  166  5e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0933  Ser/Thr protein phosphatase family protein  34.04 
 
 
374 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0995  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.34 
 
 
374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0829969  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0862  Ser/Thr protein phosphatase family protein  34.53 
 
 
374 aa  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282273  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2599  metallophosphoesterase  35.87 
 
 
372 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0926445  normal  0.0680698 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1553  acyl carrier protein  33.21 
 
 
370 aa  162  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1153  cytoplasmic membrane protein  34.34 
 
 
369 aa  160  4e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.199237  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1691  hypothetical protein  37.45 
 
 
376 aa  160  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1048  metallophosphoesterase  40.15 
 
 
371 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4551  metallophosphoesterase  38.13 
 
 
388 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.341763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3247  metallophosphoesterase  31.15 
 
 
378 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1091  metallophosphoesterase  34.9 
 
 
388 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.559041  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1132  cytoplasmic membrane protein  35.09 
 
 
370 aa  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00503148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0034  metallophosphoesterase  35.88 
 
 
375 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5967  metallophosphoesterase  42.01 
 
 
372 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.687773  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2403  metallophosphoesterase  38.63 
 
 
376 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1544  metallophosphoesterase  39.53 
 
 
395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1383  metallophosphoesterase  33.21 
 
 
365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2315  metallophosphoesterase  39.55 
 
 
395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.277964  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2809  metallophosphoesterase  33.16 
 
 
379 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2484  phosphohydrolases  35.82 
 
 
375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2658  metallophosphoesterase  35.31 
 
 
413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00191858  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1025  metallophosphoesterase  34.94 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2165  metallophosphoesterase  34.42 
 
 
369 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0975  metallophosphoesterase  33.21 
 
 
378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0084  metallophosphoesterase  27.27 
 
 
361 aa  127  5e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.31399  hitchhiker  0.000929417 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0348  metallophosphoesterase  34.98 
 
 
392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.395263  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0767  metallophosphoesterase  35.22 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4076  metallophosphoesterase  31.29 
 
 
418 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal  0.0108221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3588  metallophosphoesterase  35.19 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0201  hypothetical protein  29.65 
 
 
412 aa  116  6e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0210  hypothetical protein  29.65 
 
 
412 aa  116  6e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2542  metallophosphoesterase  30.91 
 
 
379 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0138469  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0745  metallophosphoesterase  31.01 
 
 
342 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3093  metallophosphoesterase  28.85 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0108361 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1891  hypothetical protein  31.87 
 
 
373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00188939  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2609  metallophosphoesterase  37.6 
 
 
310 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01365  hypothetical protein  29.97 
 
 
406 aa  113  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2675  metallophosphoesterase  28.96 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.477016  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0828  MutT family phosphohydrolase  29.51 
 
 
419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0242  metallophosphoesterase  35.64 
 
 
418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1218  metallophosphoesterase  25.08 
 
 
366 aa  110  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0970126  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1289  metallophosphoesterase  30.25 
 
 
392 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.322917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5501  metallophosphoesterase  26.49 
 
 
426 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00552786  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>