33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0006 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0006  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  345  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0007  hypothetical protein  46.94 
 
 		 162 aa  134  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1390  hypothetical protein  26.61 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3264  hypothetical protein  29.2 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.59265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0702  hypothetical protein  29.41 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0676  hypothetical protein  28.7 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1682  hypothetical protein  31.16 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2535  hypothetical protein  28.8 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.753717 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0849  hypothetical protein  28.45 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0054  hypothetical protein  28.45 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0854  hypothetical protein  28.45 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0311  hypothetical protein  28.45 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2440  hypothetical protein  28.45 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0606  hypothetical protein  28.45 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1014  hypothetical protein  28.45 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2662  hypothetical protein  29.52 
 
 		 148 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5946  hypothetical protein  28.57 
 
 		 145 aa  51.6  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2615  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22957  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2005  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.643515  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2644  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0472  hypothetical protein  27.43 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.323854  normal  0.0568179 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0683  hypothetical protein  27.62 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.80939  normal  0.421204 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1525  hypothetical protein  23.68 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1517  hypothetical protein  18.97 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3525  hypothetical protein  27.07 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.304757  normal  0.481308 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6217  hypothetical protein  27.45 
 
 		 158 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2702  hypothetical protein  27.27 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1166  hypothetical protein  34.78 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0416  hypothetical protein  27.72 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0424  hypothetical protein  27.72 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1308  hypothetical protein  24 
 
 		 284 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5613  hypothetical protein  24.11 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0396148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1891  putative signal peptide exported protein  24.37 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460761  normal  0.629305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>