43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0512 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0512  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  315  1e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.915743  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2096  hypothetical protein  64 
 
 
150 aa  203  7e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2735  hypothetical protein  65.35 
 
 
131 aa  183  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1941  hypothetical protein  58.52 
 
 
172 aa  181  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1673  hypothetical protein  56.72 
 
 
172 aa  176  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00536019  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001057  putative inner membrane or exported protein  52.82 
 
 
148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0949  hypothetical protein  41.78 
 
 
150 aa  133  9e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.811465  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0376  protein of unknown function DUF302  42.76 
 
 
148 aa  120  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2556  hypothetical protein  40.85 
 
 
150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299096  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1896  hypothetical protein  47.66 
 
 
135 aa  117  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1823  hypothetical protein  42.98 
 
 
131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3845  protein of unknown function DUF302  44.76 
 
 
133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0744952 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1325  camphor resistance protein CrcB  44.34 
 
 
270 aa  110  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1779  hypothetical protein  39.16 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1369  crcB family protein  44.34 
 
 
254 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1260  hypothetical protein  38.76 
 
 
157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1380  protein of unknown function DUF302  40.48 
 
 
179 aa  107  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05960  hypothetical protein  38.13 
 
 
306 aa  105  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0678707  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2075  hypothetical protein  34.97 
 
 
150 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1764  protein of unknown function DUF302  37.5 
 
 
154 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4835  hypothetical protein  35.29 
 
 
197 aa  94.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3395  hypothetical protein  32.8 
 
 
160 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8087  protein of unknown function DUF302  31.45 
 
 
163 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0349  periplasmic protein  32.64 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.112084  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2874  hypothetical protein  33.58 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4835  hypothetical protein  34.58 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.770482  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4859  hypothetical protein  34.58 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.103571 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4909  domain of unknown function superfamily  34.58 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4759  hypothetical protein  36.11 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal  0.706872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4906  hypothetical protein  36.11 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0532643 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5442  hypothetical protein  34.31 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0007  protein of unknown function DUF302  34.96 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.120765 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1665  hypothetical protein  36.19 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8650  protein of unknown function DUF302  34.62 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997368  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1272  hypothetical protein  33.03 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0543  protein of unknown function DUF302  38.89 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2704  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556991  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6375  protein of unknown function DUF302  28.07 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1972  protein of unknown function DUF302  40.96 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2794  hypothetical protein  32.61 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.4262  normal  0.709682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1559  protein of unknown function DUF302  32.5 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874349  normal  0.0163758 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5867  hypothetical protein  26.72 
 
 
202 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244323  normal  0.372797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3562  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>