More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0060 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0060  putative type I toxin secretion system,ATP-binding protein  100 
 
 		 717 aa  1478    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.442032  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0731  ABC transporter related  27.35 
 
 		 713 aa  246  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.269341  normal  0.324121 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2136  type I protein secretion ATP-binding protein  24.43 
 
 		 704 aa  190  5.999999999999999e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  25.56 
 
 		 716 aa  165  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  23.24 
 
 		 711 aa  160  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1461  ABC transporter, transmembrane region  25.93 
 
 		 719 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4147  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.35 
 
 		 694 aa  153  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0053  ABC transporter related  24.67 
 
 		 719 aa  150  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2560  type I secretion system ATPase  25.17 
 
 		 578 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  23.8 
 
 		 730 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  22.76 
 
 		 704 aa  147  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  20.77 
 
 		 723 aa  147  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  22.44 
 
 		 704 aa  147  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  22.11 
 
 		 718 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  22.38 
 
 		 743 aa  146  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  22.15 
 
 		 707 aa  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3354  type I secretion system ATPase  25 
 
 		 578 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  24.24 
 
 		 712 aa  144  6e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3835  Type I secretion system ATPase, PrtD  24.03 
 
 		 570 aa  143  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171691  normal  0.0822882 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  22.57 
 
 		 718 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3155  type I secretion system ATPase  24.96 
 
 		 578 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0529  ABC transporter related  23.24 
 
 		 871 aa  140  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.299767  normal  0.097306 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  21.31 
 
 		 726 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  24.25 
 
 		 712 aa  140  8.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  23.11 
 
 		 720 aa  140  8.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  20.97 
 
 		 687 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  22.2 
 
 		 725 aa  140  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  21.04 
 
 		 712 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  22.43 
 
 		 718 aa  139  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1596  type I secretion system ATPase  25 
 
 		 588 aa  139  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.276203  normal  0.125682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  23.02 
 
 		 740 aa  138  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  20.83 
 
 		 712 aa  137  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  21.63 
 
 		 718 aa  138  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  22.74 
 
 		 734 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16240  Type I secretion system ATPase  22.78 
 
 		 580 aa  136  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  21.97 
 
 		 762 aa  137  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3810  type I secretion system ATPase  24.02 
 
 		 711 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0802  Type I secretion system ATPase, PrtD  23.37 
 
 		 593 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  22.12 
 
 		 726 aa  135  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  20.71 
 
 		 980 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  22.99 
 
 		 718 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  21.96 
 
 		 723 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  20.89 
 
 		 726 aa  134  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  21.68 
 
 		 739 aa  134  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1409  type I secretion system ATPase  23.45 
 
 		 619 aa  134  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4512  ABC transporter related  21.06 
 
 		 745 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0916306 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  22.27 
 
 		 725 aa  134  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3161  Type I secretion system ATPase, PrtD  22.48 
 
 		 598 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2907  type I secretion system ATPase  23 
 
 		 575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  23.91 
 
 		 727 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  21.08 
 
 		 725 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  21.08 
 
 		 725 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  21.08 
 
 		 725 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  21.33 
 
 		 738 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  20.84 
 
 		 725 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  21.08 
 
 		 726 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  20.37 
 
 		 725 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0760  ABC transporter related  23.42 
 
 		 867 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00472894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  21.19 
 
 		 731 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4146  alkaline protease secretion protein AprD  23.77 
 
 		 593 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.591571  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  20.37 
 
 		 725 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  20.79 
 
 		 741 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  20.79 
 
 		 725 aa  128  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  21.43 
 
 		 731 aa  129  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  22.75 
 
 		 920 aa  127  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  21.98 
 
 		 724 aa  127  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  22.5 
 
 		 721 aa  127  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  21.98 
 
 		 724 aa  127  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3711  type I secretion system ATPase  22.9 
 
 		 742 aa  127  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.841937  normal  0.327793 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3121  ABC transporter related  22.36 
 
 		 730 aa  127  9e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  21.59 
 
 		 737 aa  127  9e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  22.25 
 
 		 725 aa  126  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4928  Type I secretion system ATPase, PrtD  22.86 
 
 		 585 aa  127  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  21.52 
 
 		 694 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4713  type I secretion system ATPase  22.32 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0148717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1761  type I secretion system ATPase  23.71 
 
 		 573 aa  126  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106544 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1190  ABC transporter-related protein  20.89 
 
 		 701 aa  126  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  21.25 
 
 		 733 aa  126  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  20.06 
 
 		 734 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  21.8 
 
 		 721 aa  125  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0512  ABC transporter-related protein  24.18 
 
 		 699 aa  125  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5958  type I secretion system ATPase  22.42 
 
 		 569 aa  125  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5907  type I secretion system ATPase  23.65 
 
 		 587 aa  124  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742047  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  21.86 
 
 		 722 aa  125  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3330  ABC transporter, ATP-binding protein  22.46 
 
 		 599 aa  124  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.355213  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3382  type I secretion system ATPase  22.47 
 
 		 579 aa  124  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  19.54 
 
 		 971 aa  124  6e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1555  type I secretion system ATPase  22.05 
 
 		 575 aa  124  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.649141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4007  type I secretion system ATPase  24.34 
 
 		 573 aa  124  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  20.22 
 
 		 976 aa  124  7e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1599  ABC drug efflux transporter, fused ATPase and inner mebrane subunits  23.36 
 
 		 751 aa  124  8e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.164249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2543  type I secretion system ATPase  24.82 
 
 		 614 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23418  normal  0.267124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48115  alkaline protease secretion protein AprD  24.22 
 
 		 593 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.969364  hitchhiker  0.00672446 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2987  ABC transporter related  22.26 
 
 		 613 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2413  ABC transporter related  22.74 
 
 		 765 aa  122  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.157605 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4207  ABC transporter related  22.59 
 
 		 706 aa  122  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0042  type I secretion system ATPase  22.03 
 
 		 577 aa  122  3e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.195884  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0513  ABC transporter-related protein  22.61 
 
 		 552 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2428  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  21.06 
 
 		 685 aa  121  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4336  putative toxin/protease secretion system  24.22 
 
 		 583 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>