More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0059 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0059  putative type I toxin secretion system, membrane transport protein  100 
 
 		 527 aa  1071    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0732  ABC transporter related  24.36 
 
 		 886 aa  123  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.93423  normal  0.195737 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4207  ABC transporter related  24.44 
 
 		 706 aa  108  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2427  ABC transporter protein  21.82 
 
 		 554 aa  104  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152948  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2135  multidrug resistance ABC transporter ATP-binding and permease protein  22.18 
 
 		 581 aa  97.8  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0731  ABC transporter related  21.55 
 
 		 713 aa  96.3  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.269341  normal  0.324121 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1818  Type I secretion system ATPase, PrtD  25.54 
 
 		 591 aa  95.5  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00373836  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0680  Type I secretion system ATPase, PrtD  22.88 
 
 		 563 aa  90.1  9e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.738771  normal  0.0936545 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  20.42 
 
 		 726 aa  89.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  20.94 
 
 		 721 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  21.64 
 
 		 725 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1409  type I secretion system ATPase  22.66 
 
 		 619 aa  88.2  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0053  ABC transporter related  20.16 
 
 		 719 aa  88.2  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  21.64 
 
 		 725 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  21.64 
 
 		 726 aa  87.4  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  19.25 
 
 		 725 aa  87.4  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2547  ABC transporter related  21.83 
 
 		 740 aa  87  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293981  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2413  ABC transporter related  21.92 
 
 		 765 aa  87  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.157605 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  22.2 
 
 		 720 aa  86.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  19.92 
 
 		 712 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4146  toxin secretion ABC transporter protein  21.56 
 
 		 549 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  20.79 
 
 		 725 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  20.12 
 
 		 726 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  22.08 
 
 		 726 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  20.59 
 
 		 725 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  20.59 
 
 		 725 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  20.59 
 
 		 725 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  21.44 
 
 		 725 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  22.93 
 
 		 1019 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0843  type I secretion system ATPase  21.28 
 
 		 722 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3121  ABC transporter related  20.4 
 
 		 730 aa  83.6  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0828  ABC transporter related  20.98 
 
 		 722 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3155  type I secretion system ATPase  21.71 
 
 		 578 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0804  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  21.1 
 
 		 722 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0384616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16240  Type I secretion system ATPase  23.53 
 
 		 580 aa  82.4  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  20.04 
 
 		 725 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.32 
 
 		 581 aa  82  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  19.72 
 
 		 712 aa  82.4  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2560  type I secretion system ATPase  21.38 
 
 		 578 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3354  type I secretion system ATPase  21.59 
 
 		 578 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  21.67 
 
 		 725 aa  82  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3835  Type I secretion system ATPase, PrtD  20.36 
 
 		 570 aa  81.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171691  normal  0.0822882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1639  Type I secretion system ATPase, PrtD  19.84 
 
 		 582 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3863  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  20.08 
 
 		 736 aa  80.9  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779093  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  21.87 
 
 		 716 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  20.78 
 
 		 726 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0513  ABC transporter-related protein  18.7 
 
 		 552 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3410  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  18.83 
 
 		 713 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277715  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  19.29 
 
 		 723 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2004  type I secretion system ATPase  20.5 
 
 		 715 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2551  type I secretion system ATPase  23.18 
 
 		 578 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.961125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  20.36 
 
 		 722 aa  79.7  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  20.72 
 
 		 739 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0042  type I secretion system ATPase  23.84 
 
 		 577 aa  79  0.0000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.195884  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  19.25 
 
 		 727 aa  79  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40240  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  18.75 
 
 		 723 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.587032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  19.93 
 
 		 980 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  19.61 
 
 		 741 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2837  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  19.65 
 
 		 726 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  20.16 
 
 		 762 aa  78.2  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1891  toxin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  20.29 
 
 		 715 aa  77.8  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2906  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  19.46 
 
 		 726 aa  77.8  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.452451  normal  0.0897932 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1322  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.59 
 
 		 707 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0655788  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1000  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.59 
 
 		 707 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0293  peptidase  22.59 
 
 		 707 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  21.51 
 
 		 906 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1734  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.59 
 
 		 707 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0274  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.59 
 
 		 707 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259681  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1818  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.59 
 
 		 707 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263264  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2907  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  19.46 
 
 		 726 aa  77.4  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  21.67 
 
 		 767 aa  77.4  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  21.51 
 
 		 906 aa  77  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1138  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.59 
 
 		 707 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  22.41 
 
 		 738 aa  77  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  24.05 
 
 		 718 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0115  type I secretion system ATPase  22.75 
 
 		 578 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.869815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2888  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  19.1 
 
 		 726 aa  77  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110147 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  21.66 
 
 		 712 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  22.37 
 
 		 733 aa  76.3  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  23.99 
 
 		 1038 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4390  type I secretion system ATPase  23.2 
 
 		 582 aa  76.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.500904 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  20.79 
 
 		 704 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0584  type I secretion system ATPase family protein  19.81 
 
 		 720 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  24.17 
 
 		 718 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0167  toxin secretion ATP-binding protein  23.93 
 
 		 718 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0186  ABC transporter related  23.93 
 
 		 718 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0846231 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0892  protein toxin ABC transporter ATPase and inner membrane subunit  23.18 
 
 		 578 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287416  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4007  type I secretion system ATPase  21.3 
 
 		 573 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  20.89 
 
 		 976 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  23.99 
 
 		 1038 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  19.31 
 
 		 726 aa  75.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4601  type I secretion system ATPase  19.62 
 
 		 730 aa  75.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  20.45 
 
 		 920 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  20.7 
 
 		 734 aa  75.1  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  19.92 
 
 		 1008 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  21.74 
 
 		 908 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  19.92 
 
 		 1008 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  20.46 
 
 		 756 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  20.11 
 
 		 734 aa  74.7  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  22.85 
 
 		 738 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>