181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0007 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2394  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2430  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.275701  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2543  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.286473  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2469  transposase  99.89 
 
 
882 bp  1740    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2461  transposase  99.71 
 
 
348 bp  668    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2596    99.8 
 
 
3269 bp  1978    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2488  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2405  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2485  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991147  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2323  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2322    100 
 
 
1889 bp  1992    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0015  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.461539  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0038  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0069  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0112  transposase  99.89 
 
 
882 bp  1740    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0114  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2597  transposase  99.77 
 
 
882 bp  1733    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0143  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0154    99.71 
 
 
347 bp  660    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151974  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0200    100 
 
 
1727 bp  1992    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0201  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.939857  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0215  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2599  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0235  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.800735  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0280  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0286  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0290  transposase  99.71 
 
 
348 bp  668    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0316  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0165455  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0317  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933695  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0436  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0443    100 
 
 
2360 bp  1992    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0444  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0515  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0744  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.506929  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0765    99.71 
 
 
348 bp  668    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0782  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00298688  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0810  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0862  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0896  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.013986  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0904  transposase  99.71 
 
 
348 bp  668    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0917  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0958    100 
 
 
2531 bp  1994    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0712099  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0959  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137589  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0972  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260253  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0999  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1051  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1062  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0794003  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1106    99.71 
 
 
347 bp  660    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1206  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1209  transposase  99.89 
 
 
882 bp  1740    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1218  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.148631  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1240  transposase  99.71 
 
 
348 bp  668    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1257  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1267    99.41 
 
 
347 bp  652    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1276  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.623612  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1279  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.507833  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1292  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.035818  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1315    99.71 
 
 
347 bp  660    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.550574  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1338    100 
 
 
2177 bp  1994    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1339  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1348  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1362  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1365  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1410  transposase  99.89 
 
 
882 bp  1740    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1416  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1441  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.363136  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1459  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157212  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1522  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.269856  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1575  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.522736  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1601  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.174861  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1605  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1652  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158207  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1655  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0420021  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1663  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0780346  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1671  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0737261  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1691    100 
 
 
1775 bp  1992    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1692  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.250991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1703  transposase  99.89 
 
 
882 bp  1740    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1715  transposase  99.71 
 
 
348 bp  668    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1746  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1777  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.167133  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1779  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.076301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1810  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.106674  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1834  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1929  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.721317  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1944  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1993  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2010  transposase  99.71 
 
 
348 bp  668    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2015  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2043  transposase  99.71 
 
 
348 bp  668    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2051  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.687702  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2070  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2087  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2115  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2162  transposase  99.71 
 
 
348 bp  668    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2179  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2249  transposase  100 
 
 
348 bp  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327358  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2251  transposase  100 
 
 
882 bp  1748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2261  transposase  99.71 
 
 
348 bp  668    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2265    99.71 
 
 
347 bp  660    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>