77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1323 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1323  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  336  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0103  hypothetical protein  58.94 
 
 		 152 aa  194  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.664963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3098  hypothetical protein  56.86 
 
 		 153 aa  190  6e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3749  hypothetical protein  57.53 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1273  hypothetical protein  53.5 
 
 		 157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3852  hypothetical protein  46.41 
 
 		 154 aa  158  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3187  hypothetical protein  46.41 
 
 		 156 aa  157  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.490113  hitchhiker  0.000481083 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0751  hypothetical protein  45.75 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0266116 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0779  hypothetical protein  45.75 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.023877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0677  hypothetical protein  45.45 
 
 		 156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3633  hypothetical protein  45.45 
 
 		 156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.059519  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3565  protein of unknown function DUF1456  45.45 
 
 		 154 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3756  hypothetical protein  44.81 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0785  hypothetical protein  45.1 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0737  hypothetical protein  43.79 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3517  hypothetical protein  43.51 
 
 		 154 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0903  hypothetical protein  44.16 
 
 		 154 aa  150  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2963  hypothetical protein  44.16 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0834  hypothetical protein  42.86 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2620  hypothetical protein  42.76 
 
 		 155 aa  147  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.481064  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3185  hypothetical protein  42.86 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4022  hypothetical protein  43.42 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0731  hypothetical protein  43.12 
 
 		 160 aa  140  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.406877  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1420  hypothetical protein  43.54 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1917  protein of unknown function DUF1456  46.41 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1389  hypothetical protein  42.48 
 
 		 153 aa  137  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1548  protein of unknown function DUF1456  39.61 
 
 		 153 aa  137  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.54796  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2306  protein of unknown function DUF1456  46.41 
 
 		 158 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142002  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1190  hypothetical protein  44.44 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1221  hypothetical protein  43.79 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2726  hypothetical protein  40.52 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1341  hypothetical protein  45.1 
 
 		 157 aa  134  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0612895 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2874  hypothetical protein  45.1 
 
 		 157 aa  134  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2795  hypothetical protein  45.1 
 
 		 157 aa  134  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4226  hypothetical protein  43.79 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1188  hypothetical protein  43.87 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2722  hypothetical protein  39.46 
 
 		 155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0920  hypothetical protein  38.78 
 
 		 156 aa  130  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4019  hypothetical protein  42.48 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02011  hypothetical protein  38.1 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1523  hypothetical protein  38.1 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3111  hypothetical protein  38.1 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.269934 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0864  hypothetical protein  38.1 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1534  protein of unknown function DUF1456  38.1 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00928  hypothetical protein  39.6 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2412  hypothetical protein  38.1 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2258  hypothetical protein  38.1 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02053  hypothetical protein  38.1 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0430  hypothetical protein  38.24 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0308  hypothetical protein  38.24 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00327546  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0368  hypothetical protein  37.65 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2396  putative cytoplasmic protein  38.1 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.740518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2303  putative cytoplasmic protein  38.1 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0321  hypothetical protein  37.65 
 
 		 172 aa  124  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000361969  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1400  hypothetical protein  40.74 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000593967  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2392  hypothetical protein  38.1 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.238973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2347  putative cytoplasmic protein  38.1 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0336  hypothetical protein  37.65 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000656402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0383  hypothetical protein  38.24 
 
 		 172 aa  124  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2504  hypothetical protein  38.1 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.705894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0412  hypothetical protein  37.65 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000341313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0430  hypothetical protein  37.65 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3062  hypothetical protein  41.56 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.590998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0316  hypothetical protein  38.24 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4936  hypothetical protein  37.65 
 
 		 172 aa  121  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00472073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0277  protein of unknown function DUF1456  40 
 
 		 155 aa  120  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23151 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0304  hypothetical protein  37.06 
 
 		 172 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000469765  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03268  YehS  39.61 
 
 		 157 aa  117  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1414  hypothetical protein  40.26 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1514  protein of unknown function DUF1456  40.41 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4597  hypothetical protein  40.52 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52430  hypothetical protein  40.52 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3447  hypothetical protein  37.66 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144286  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1572  hypothetical protein  31.48 
 
 		 188 aa  97.4  7e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2166  hypothetical protein  52.44 
 
 		 154 aa  89  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0524775  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00810  hypothetical protein  46.91 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0798897  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1012  protein of unknown function DUF1456  41.46 
 
 		 83 aa  75.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>