More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1190 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1190  putative fumarylacetoacetate hydrolase  100 
 
 
204 aa  426  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.43938  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001438  2-keto-4-pentenoate hydratase  67.49 
 
 
204 aa  295  3e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.301342  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06282  2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase  65.52 
 
 
204 aa  287  8e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0233  hypothetical protein  62.56 
 
 
204 aa  287  8e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2723  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  55.39 
 
 
203 aa  236  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1535  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  53.43 
 
 
203 aa  231  5e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0341155  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1865  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  52.71 
 
 
203 aa  230  9e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.601886  normal  0.0120347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1387  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  52.4 
 
 
208 aa  226  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1314  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  52.4 
 
 
208 aa  223  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2951  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  52.43 
 
 
208 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.747988  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1403  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  51.94 
 
 
208 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1426  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  51.94 
 
 
208 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.768484  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1585  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  53.11 
 
 
208 aa  221  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2857  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  52.63 
 
 
208 aa  221  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2689  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  51.94 
 
 
208 aa  216  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.490642  normal  0.0512054 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2757  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  51.94 
 
 
208 aa  215  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.530786  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0057  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  48.77 
 
 
204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0702  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  47.93 
 
 
217 aa  209  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2637  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  50.8 
 
 
223 aa  205  5e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1093  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.8 
 
 
202 aa  202  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.391671 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1216  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  56.63 
 
 
230 aa  201  8e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1402  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  48.51 
 
 
204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2939  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.08 
 
 
203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.494423  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0979  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.86 
 
 
212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202477  normal  0.468073 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4230  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.57 
 
 
232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4850  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.04 
 
 
221 aa  134  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5292  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  39.57 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4986  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.12 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0585  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  39.39 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04150  hypothetical protein  39.39 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0411  hypothetical protein  37.37 
 
 
221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0650  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.2 
 
 
218 aa  131  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3591  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  41.54 
 
 
218 aa  131  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000122928  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0882  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.92 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308706 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0299  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.75 
 
 
238 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0663  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  36.84 
 
 
218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8085999999999997e-26 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3666  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  37.5 
 
 
218 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0202115  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5385  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.56 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.02221 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48300  Fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein  37.81 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2937  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.27 
 
 
218 aa  126  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000218618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1536  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.77 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0330  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.32 
 
 
238 aa  125  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0312  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.9 
 
 
221 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.163162 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2800  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.97 
 
 
219 aa  125  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9861  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2815  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.27 
 
 
220 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1979  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.22 
 
 
205 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5206  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.76 
 
 
221 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.640418  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13578  putative hydrolase  38.17 
 
 
204 aa  122  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.503047  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2106  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.95 
 
 
203 aa  121  7e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5153  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.22 
 
 
221 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479206  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5060  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.22 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01142  putative fumarylacetoacetate hydrolase family protein  34.3 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0543  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.02 
 
 
225 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0262694  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0603  FAA hydrolase family protein  34.5 
 
 
217 aa  117  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000290593  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1996  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39 
 
 
214 aa  118  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2004  hypothetical protein  36.68 
 
 
218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.394178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2468  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  37.04 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0015022  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01155  predicted isomerase/hydrolase  35.45 
 
 
219 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00189492  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1324  hypothetical protein  35.45 
 
 
219 aa  115  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369423  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01165  hypothetical protein  35.45 
 
 
219 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013679  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1335  hypothetical protein  35.45 
 
 
219 aa  115  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00641682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2445  hypothetical protein  35.45 
 
 
219 aa  115  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000248355  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1280  hypothetical protein  35.45 
 
 
219 aa  115  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000019251  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1666  hypothetical protein  35.45 
 
 
219 aa  115  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000638137  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1114  5-oxopent-3-ene-1,2,5- tricarboxylatedecarboxylas e  32.14 
 
 
219 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2753  hypothetical protein  37.23 
 
 
218 aa  114  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000267242  hitchhiker  0.000114559 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1891  2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase  34.05 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00665763 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2369  hypothetical protein  35.98 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000473957  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1942  hypothetical protein  34.17 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000035991  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1969  hypothetical protein  35.45 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000105527  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2238  hypothetical protein  35.68 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000304661  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1999  hypothetical protein  34.67 
 
 
218 aa  112  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00012789  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2087  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.16 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1185  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  34.04 
 
 
219 aa  111  8.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2118  hypothetical protein  36.7 
 
 
218 aa  111  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0891763  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2395  hypothetical protein  36.7 
 
 
218 aa  111  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0911799  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2007  hypothetical protein  36.7 
 
 
218 aa  111  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0101882  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1321  hypothetical protein  35 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114215  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1951  hypothetical protein  35.29 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1505  hypothetical protein  35.29 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474935  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1954  hypothetical protein  35.29 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0707644  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2011  hypothetical protein  35.29 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.517468  normal  0.203097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0383  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.588829 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80437  fumarylacetoacetate hydralase  35.45 
 
 
231 aa  107  9.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0346038  normal  0.482803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0279  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.56 
 
 
266 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.559934  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0260  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  31.58 
 
 
233 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0239  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  31.1 
 
 
233 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0332  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  33.33 
 
 
233 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3195  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.83 
 
 
238 aa  105  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.48446  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1014  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  30.45 
 
 
249 aa  105  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0403073 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1261  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.24 
 
 
246 aa  104  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1318  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.18 
 
 
239 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0072  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.24 
 
 
225 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.620736  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4220  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.84 
 
 
232 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4146  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.84 
 
 
232 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160093  normal  0.0450564 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1531  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  36.13 
 
 
202 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3146  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.3 
 
 
235 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711497  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3169  FAA-hydrolase-family protein  30.41 
 
 
232 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0980  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  35.48 
 
 
256 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2453  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.58 
 
 
233 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>