33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0834 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0834  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  318  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01340  hypothetical protein  62.99 
 
 
167 aa  214  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004125  hypothetical protein  62.34 
 
 
167 aa  211  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000493845  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1689  hypothetical protein  59.09 
 
 
166 aa  199  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000692743  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5105  hypothetical protein  46.94 
 
 
160 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0979763  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5258  hypothetical protein  46.94 
 
 
160 aa  156  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5198  hypothetical protein  46.94 
 
 
160 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5023  hypothetical protein  48.98 
 
 
160 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5432  hypothetical protein  45.39 
 
 
161 aa  150  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5965  hypothetical protein  45.58 
 
 
160 aa  148  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68970  hypothetical protein  44.9 
 
 
160 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2166  hypothetical protein  38.93 
 
 
184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0956  hypothetical protein  43.07 
 
 
141 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01871  lipoprotein, putative  41.96 
 
 
223 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1255  hypothetical protein  40.27 
 
 
179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.641108  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1327  hypothetical protein  42.36 
 
 
162 aa  124  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2917  hypothetical protein  38.1 
 
 
150 aa  125  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.389629  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2397  hypothetical protein  41.22 
 
 
152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1855  hypothetical protein  41.04 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790822  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2318  hypothetical protein  38.89 
 
 
185 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.701978  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2015  hypothetical protein  38.19 
 
 
185 aa  113  8.999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00179761  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00290  hypothetical protein  40.97 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1802  hypothetical protein  37.24 
 
 
174 aa  110  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45413  predicted protein  32.24 
 
 
175 aa  99.4  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000791095  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2058  hypothetical protein  35.66 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1465  hypothetical protein  34.27 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1551  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  97.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147627  hitchhiker  0.00645173 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0513  hypothetical protein  32.39 
 
 
172 aa  94  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00777462  normal  0.634393 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0975  hypothetical protein  32.89 
 
 
157 aa  92.8  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.149641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3579  hypothetical protein  31.76 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3511  hypothetical protein  31.43 
 
 
163 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0090  hypothetical protein  31.47 
 
 
176 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2158  translation elongation factor P (EF-P)  27.33 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.401757  normal  0.635134 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>