15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_p08174 on replicon NC_009777
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009777  VIBHAR_p08174  relaxase NikB  100 
 
 
977 aa  2026    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0051  relaxase  37.48 
 
 
1201 aa  339  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0037  relaxase  31.45 
 
 
1065 aa  337  5.999999999999999e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204416  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7564  relaxase/mobilization nuclease family protein  36.23 
 
 
1019 aa  227  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0784017  normal  0.290124 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03011  hypothetical protein  78.18 
 
 
56 aa  93.6  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0949  aminotransferase  28.85 
 
 
816 aa  61.2  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0482781  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1093  relaxase/mobilization nuclease domain protein  34.57 
 
 
805 aa  54.7  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246621  n/a   
 
 
-
 
NC_009713  CHAB381_A0005  mobilization protein  26.1 
 
 
535 aa  52.8  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4315  conjugal transfer relaxase TraI  42.25 
 
 
752 aa  52  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599721  normal 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0026  conjugal transfer relaxase TraI  28.1 
 
 
873 aa  51.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771366  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4982  relaxase/mobilization nuclease family protein  29.82 
 
 
843 aa  48.5  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154729  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6526  conjugal transfer relaxase TraI  37.5 
 
 
746 aa  47.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439323  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6611  conjugal transfer relaxase TraI  37.5 
 
 
746 aa  47.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5006  relaxase/mobilization nuclease family protein  21.01 
 
 
828 aa  47.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1365  mobilization protein  24.88 
 
 
621 aa  47.4  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>