47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04886 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04886  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  630  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000760  VirK protein  80.47 
 
 		 302 aa  512  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0935  hypothetical protein  29.13 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0127626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2765  protein of unknown function DUF535  30.86 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0819238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2719  hypothetical protein  30.86 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.805745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0981  hypothetical protein  30.86 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.47492  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00882  hypothetical protein  29.54 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2453  hypothetical protein  29.54 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0233718  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2284  hypothetical protein  29.54 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00241499  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0949  hypothetical protein  29.54 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.422443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00888  hypothetical protein  29.54 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1037  hypothetical protein  30.86 
 
 		 330 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1394  hypothetical protein  28.52 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.0750747 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2613  hypothetical protein  27.68 
 
 		 315 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1007  hypothetical protein  30.14 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.690632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0941  hypothetical protein  30.14 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.374104  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1058  hypothetical protein  30.14 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.947736 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1595  hypothetical protein  27.68 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1038  hypothetical protein  30.14 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.687101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2697  hypothetical protein  27.68 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0975  VirK-like protein  30.14 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.587318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1669  hypothetical protein  26.81 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2409  hypothetical protein  29.71 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3894  hypothetical protein  30.71 
 
 		 341 aa  96.3  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831211  normal  0.569871 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1208  protein of unknown function DUF535  30.04 
 
 		 331 aa  89.4  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4270  hypothetical protein  24.46 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2907  hypothetical protein  27 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.924557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2717  hypothetical protein  29.41 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0233  protein of unknown function DUF535  24.58 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1902  hypothetical protein  27.69 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.956039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3138  VirK domain-containing protein  28.57 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2576  hypothetical protein  27.73 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3078  hypothetical protein  26.87 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2837  protein of unknown function DUF535  25.44 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2975  virulence protein  26.22 
 
 		 309 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.188395 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2956  virulence protein  26.22 
 
 		 309 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492438  hitchhiker  0.00000541429 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2922  hypothetical protein  26.22 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0345216 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2892  virulence protein  26.49 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0063  hypothetical protein  26.52 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0044  hypothetical protein  26.52 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.793542  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0262  hypothetical protein  26.52 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4853  hypothetical protein  26.52 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1087  hypothetical protein  27.45 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1212  hypothetical protein  26.53 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1361  hypothetical protein  28.57 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000275115  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0654  hypothetical protein  25.35 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1515  hypothetical protein  23.18 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>