52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00073 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00073  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  141  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002281  hypothetical protein  91.43 
 
 
70 aa  134  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0295  hypothetical protein  75.71 
 
 
80 aa  112  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2189  hypothetical protein  75.76 
 
 
69 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3551  hypothetical protein  64.29 
 
 
72 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03157  hypothetical protein  64.29 
 
 
72 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0634191  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4664  hypothetical protein  64.29 
 
 
72 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.011231  normal  0.0773241 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3729  hypothetical protein  64.29 
 
 
72 aa  98.2  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3636  hypothetical protein  64.29 
 
 
72 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000470903 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0358  hypothetical protein  64.29 
 
 
72 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.239979  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3824  hypothetical protein  64.29 
 
 
72 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0227222  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03205  hypothetical protein  64.29 
 
 
72 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0639443  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0358  protein of unknown function UPF0270  64.29 
 
 
72 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.882384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3734  hypothetical protein  65.71 
 
 
72 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0611332 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3768  hypothetical protein  65.71 
 
 
72 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.396032 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3659  hypothetical protein  65.71 
 
 
72 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3831  hypothetical protein  65.71 
 
 
72 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3660  hypothetical protein  64.29 
 
 
72 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.420056  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3781  hypothetical protein  61.43 
 
 
72 aa  93.2  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.10746  normal  0.0118035 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0296  protein of unknown function UPF0270  60 
 
 
76 aa  90.9  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.771605  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0372  protein of unknown function UPF0270  67.19 
 
 
78 aa  91.3  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4029  putative hydrolase  54.29 
 
 
417 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3850  hypothetical protein  57.14 
 
 
78 aa  88.6  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3941  hypothetical protein  58.57 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0255  hypothetical protein  58.57 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3698  hypothetical protein  58.57 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4577  hypothetical protein  54.29 
 
 
77 aa  84.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0512323  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0135  hypothetical protein  57.81 
 
 
78 aa  84.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0429  hypothetical protein  56.25 
 
 
78 aa  77  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0140  hypothetical protein  45.71 
 
 
79 aa  76.3  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.646675  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03977  hypothetical protein  55.22 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0389  hypothetical protein  54.69 
 
 
75 aa  72  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0731708  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0177  hypothetical protein  53.23 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0235  protein of unknown function UPF0270  53.23 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3404  hypothetical protein  39.34 
 
 
78 aa  57.4  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.407914  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1630  hypothetical protein  48.21 
 
 
75 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315026  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1459  hypothetical protein  47.27 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000230773  normal  0.400071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3750  hypothetical protein  48.21 
 
 
75 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0947299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35000  hypothetical protein  49.09 
 
 
75 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0420993  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1297  hypothetical protein  40.58 
 
 
78 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.600836  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19330  hypothetical protein  36.23 
 
 
76 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1664  hypothetical protein  36.23 
 
 
76 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1339  hypothetical protein  40.58 
 
 
75 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1151  hypothetical protein  38.57 
 
 
82 aa  50.8  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4103  hypothetical protein  38.81 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2959  hypothetical protein  38.81 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0676986  normal  0.0229557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3967  hypothetical protein  40.58 
 
 
75 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1747  hypothetical protein  40.58 
 
 
75 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2567  hypothetical protein  40.32 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000225373  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2862  hypothetical protein  32.26 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2087  hypothetical protein  38.71 
 
 
87 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569443  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3001  hypothetical protein  34.21 
 
 
83 aa  40.8  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.400901  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>