More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00002 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_r00001  16S ribosomal RNA  90.28 
 
 		 1542 bp  1471    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.01898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00006  16S ribosomal RNA  90.28 
 
 		 1542 bp  1471    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0446208  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00010  16S ribosomal RNA  90.89 
 
 		 1542 bp  1548    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00367496  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00011  16S ribosomal RNA  90.28 
 
 		 1542 bp  1471    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0360816  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00014  16S ribosomal RNA  90.89 
 
 		 1542 bp  1548    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0514001  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00017  16S ribosomal RNA  90.89 
 
 		 1542 bp  1548    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0241491  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00020  16S ribosomal RNA  90.28 
 
 		 1542 bp  1471    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0158539  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0003  16S ribosomal RNA  90.36 
 
 		 1530 bp  1479    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000874227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0027  16S ribosomal RNA  90.44 
 
 		 1530 bp  1487    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0078  16S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 1530 bp  1532    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571707  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0090  16S ribosomal RNA  90.36 
 
 		 1530 bp  1479    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000103004  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0098  16S ribosomal RNA  90.36 
 
 		 1530 bp  1479    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000143523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0103  16S ribosomal RNA  90.28 
 
 		 1530 bp  1471    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00308735  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0113  16S ribosomal RNA  90.44 
 
 		 1530 bp  1473    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000562425  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0001  16S ribosomal RNA  90.67 
 
 		 1535 bp  1519    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000556781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0007  16S ribosomal RNA  90.67 
 
 		 1535 bp  1519    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000706702  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0015  16S ribosomal RNA  90.51 
 
 		 1535 bp  1517    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120948  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0044  16S ribosomal RNA  90.51 
 
 		 1533 bp  1517    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000361532  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0107  16S ribosomal RNA  90.67 
 
 		 1535 bp  1519    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000137166  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0119  16S ribosomal RNA  90.51 
 
 		 1533 bp  1517    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000133633  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0122  16S ribosomal RNA  90.66 
 
 		 1535 bp  1532    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0472105  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0127  16S ribosomal RNA  90.67 
 
 		 1535 bp  1519    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0001  16S ribosomal RNA  90.37 
 
 		 1535 bp  1473    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000282718  hitchhiker  0.000910883 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0007  16S ribosomal RNA  90.22 
 
 		 1535 bp  1469    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150491  normal  0.406366 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0016  16S ribosomal RNA  90.38 
 
 		 1535 bp  1485    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201681  hitchhiker  0.0000000136741 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0071  16S ribosomal RNA  90.6 
 
 		 1535 bp  1497    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00148247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0123  16S ribosomal RNA  90.38 
 
 		 1535 bp  1485    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0163335  normal  0.34966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0132  16S ribosomal RNA  90.38 
 
 		 1535 bp  1485    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0261242  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0136  16S ribosomal RNA  90.15 
 
 		 1535 bp  1461    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000885648  hitchhiker  0.000140032 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0140  16S ribosomal RNA  90.38 
 
 		 1535 bp  1485    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00248839  normal  0.547637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0143  16S ribosomal RNA  90.68 
 
 		 1535 bp  1505    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000577207  normal  0.0309772 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0001  16S ribosomal RNA  90.53 
 
 		 1535 bp  1485    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00134291  hitchhiker  0.00347665 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0007  16S ribosomal RNA  89.91 
 
 		 1535 bp  1437    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0064778  normal  0.0127919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0016  16S ribosomal RNA  90.52 
 
 		 1535 bp  1489    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00459376  normal  0.131368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0020  16S ribosomal RNA  90.07 
 
 		 1535 bp  1453    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000189863  hitchhiker  0.00241785 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0026  16S ribosomal RNA  90.3 
 
 		 1535 bp  1477    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0396739  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0071  16S ribosomal RNA  90.22 
 
 		 1535 bp  1469    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00107251  normal  0.159667 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0123  16S ribosomal RNA  90.22 
 
 		 1535 bp  1469    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00322133  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0141  16S ribosomal RNA  90.15 
 
 		 1535 bp  1461    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00125257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0144  16S ribosomal RNA  90.3 
 
 		 1535 bp  1477    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0816172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0001  16S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 1535 bp  1455    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000442431  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0004  16S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 1535 bp  1455    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000248814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0013  16S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 1535 bp  1455    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0027  16S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 1535 bp  1455    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000222685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0030  16S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 1535 bp  1455    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000656968  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0061  16S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 1535 bp  1455    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000486947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0121  16S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 1535 bp  1455    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000475957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0128  16S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 1535 bp  1455    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000157224  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0133  16S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 1535 bp  1455    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000510938  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0001  16S ribosomal RNA  90.37 
 
 		 1555 bp  1473    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00112036  hitchhiker  0.0000014858 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0007  16S ribosomal RNA  90.44 
 
 		 1555 bp  1481    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0012678  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0016  16S ribosomal RNA  90.68 
 
 		 1555 bp  1505    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251895  hitchhiker  0.00000000270434 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0069  16S ribosomal RNA  90.27 
 
 		 1555 bp  1493    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00426901  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0120  16S ribosomal RNA  90.27 
 
 		 1555 bp  1493    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0520691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0130  16S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 1555 bp  1509    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0100831  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0136  16S ribosomal RNA  90.27 
 
 		 1555 bp  1493    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000629377  hitchhiker  0.000146985 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0140  16S ribosomal RNA  90.37 
 
 		 1555 bp  1473    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0143  16S ribosomal RNA  90.27 
 
 		 1555 bp  1493    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.328707  normal  0.910288 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0007  16S ribosomal RNA  90.9 
 
 		 1545 bp  1534    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010889  decreased coverage  0.00540958 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0019  16S ribosomal RNA  90.75 
 
 		 1545 bp  1519    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000981314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0068  16S ribosomal RNA  90.98 
 
 		 1545 bp  1542    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000738133  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0088  16S ribosomal RNA  90.9 
 
 		 1545 bp  1534    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00544276  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0093  16S ribosomal RNA  90.98 
 
 		 1545 bp  1542    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0247267  decreased coverage  0.00226048 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0104  16S ribosomal RNA  90.98 
 
 		 1545 bp  1542    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000542682  decreased coverage  0.0046973 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0108  16S ribosomal RNA  90.75 
 
 		 1545 bp  1519    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0133586  normal  0.0202407 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0001  16S ribosomal RNA  90.3 
 
 		 1555 bp  1477    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000995354  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0005  16S ribosomal RNA  90.52 
 
 		 1555 bp  1489    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000520718  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0009  16S ribosomal RNA  90.3 
 
 		 1555 bp  1477    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000407076  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0021  16S ribosomal RNA  90.52 
 
 		 1555 bp  1489    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267003  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0068  16S ribosomal RNA  89.9 
 
 		 1555 bp  1425    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000082841  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0115  16S ribosomal RNA  90.3 
 
 		 1555 bp  1477    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0123  16S ribosomal RNA  90.22 
 
 		 1555 bp  1469    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0112353  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0130  16S ribosomal RNA  90.52 
 
 		 1555 bp  1489    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0256321  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0241  16S ribosomal RNA  94.48 
 
 		 1536 bp  1797    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000165146  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2076  16S ribosomal RNA  94.65 
 
 		 1535 bp  1813    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000346352  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2332  16S ribosomal RNA  94.56 
 
 		 1535 bp  1805    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0176289  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2338  16S ribosomal RNA  94.48 
 
 		 1535 bp  1797    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000750964  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2460  16S ribosomal RNA  94.48 
 
 		 1535 bp  1797    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000585775  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2540  16S ribosomal RNA  94.56 
 
 		 1536 bp  1805    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000260054  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2706  16S ribosomal RNA  94.65 
 
 		 1536 bp  1813    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000399166  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2799  16S ribosomal RNA  94.48 
 
 		 1536 bp  1797    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000312291  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0006  16S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 1537 bp  1423    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000817728  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0015  16S ribosomal RNA  90.22 
 
 		 1537 bp  1453    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00010598  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0019  16S ribosomal RNA  89.99 
 
 		 1537 bp  1425    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000102694  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0027  16S ribosomal RNA  90.22 
 
 		 1537 bp  1449    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000499346  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0082  16S ribosomal RNA  89.91 
 
 		 1537 bp  1421    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000820075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0137  16S ribosomal RNA  90.22 
 
 		 1537 bp  1453    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00224733  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0140  16S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 1537 bp  1423    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.471894  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4189  16S ribosomal RNA  89.97 
 
 		 1543 bp  1447    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000402751  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4193  16S ribosomal RNA  91.62 
 
 		 1543 bp  1445    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000141803  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4203  16S ribosomal RNA  91.62 
 
 		 1543 bp  1445    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000007625  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4215  16S ribosomal RNA  91.62 
 
 		 1555 bp  1445    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000328918  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4266  16S ribosomal RNA  91.62 
 
 		 1555 bp  1445    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000141511  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4285  16S ribosomal RNA  91.62 
 
 		 1555 bp  1445    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4294  16S ribosomal RNA  91.62 
 
 		 1555 bp  1445    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000166235  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00002  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1397 bp  2755    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00198  16S ribosomal RNA  99.35 
 
 		 1565 bp  2645    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00204  16S ribosomal RNA  99.28 
 
 		 1565 bp  2637    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00254  16S ribosomal RNA  99.28 
 
 		 1565 bp  2637    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00331  16S ribosomal RNA  99.43 
 
 		 1565 bp  2653    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>