31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001696 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_001696  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  133  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00777  hypothetical protein  75.76 
 
 
83 aa  104  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0431  hypothetical protein  59.09 
 
 
69 aa  86.3  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0355926  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0819  protein of unknown function DUF1107  45.31 
 
 
68 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.500375  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3578  protein of unknown function DUF1107  48.44 
 
 
68 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.438449  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3419  hypothetical protein  48.44 
 
 
68 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.483164  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0785  protein of unknown function DUF1107  43.75 
 
 
68 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0456  hypothetical protein  44.62 
 
 
68 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0230817  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4804  hypothetical protein  46.77 
 
 
68 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104047  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4685  hypothetical protein  46.77 
 
 
68 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00987973  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4674  hypothetical protein  46.77 
 
 
68 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.013145  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4825  hypothetical protein  46.77 
 
 
68 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.486478  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4770  hypothetical protein  46.77 
 
 
68 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3775  protein of unknown function DUF1107  45.31 
 
 
68 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04051  hypothetical protein  45.31 
 
 
68 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5734  hypothetical protein  45.31 
 
 
68 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4865  hypothetical protein  45.31 
 
 
68 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4695  hypothetical protein  45.31 
 
 
68 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3790  hypothetical protein  45.31 
 
 
68 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4786  hypothetical protein  45.31 
 
 
68 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4470  hypothetical protein  45.31 
 
 
68 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04088  hypothetical protein  45.31 
 
 
68 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0395  hypothetical protein  43.08 
 
 
68 aa  67.8  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0710547  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3773  hypothetical protein  43.75 
 
 
70 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3959  hypothetical protein  43.75 
 
 
70 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.289432  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3628  hypothetical protein  43.75 
 
 
70 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2050  hypothetical protein  49.21 
 
 
77 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21203  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002486  hypothetical protein  44.44 
 
 
68 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0278868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03548  hypothetical protein  42.86 
 
 
68 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0842  hypothetical protein  37.88 
 
 
81 aa  47  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.060243  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2536  hypothetical protein  31.58 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>