52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1743 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1743  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  160  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03192  hypothetical protein  48.57 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002789  hypothetical protein  47.76 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  44 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  44 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2418  SirA family protein  44 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.753437  hitchhiker  0.000838905 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2383  hypothetical protein  43.64 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  42 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2086  SirA family protein  45.83 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1696  SirA family protein  42 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2494  SirA family protein  42 
 
 		 77 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1828  SirA family protein  42 
 
 		 77 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.263187  normal  0.225214 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1784  SirA family protein  42 
 
 		 77 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832592  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1791  SirA family protein  42 
 
 		 77 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2170  SirA family protein  33.33 
 
 		 73 aa  42  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  31.82 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  36.17 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1905  SirA family protein  39.58 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1972  SirA family protein  36.73 
 
 		 71 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  38.3 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  36.17 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  38.3 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0357  SirA family protein  33.8 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105762  hitchhiker  0.000384401 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  33.9 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1455  SirA family protein  29.23 
 
 		 74 aa  40.4  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316855  normal  0.421643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  38.3 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  38.3 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  38.3 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  36.17 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  38.3 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  38.3 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  38.3 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  38.64 
 
 		 81 aa  40  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  38.64 
 
 		 81 aa  40  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  38.3 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  38.64 
 
 		 81 aa  40  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  38.3 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  38.3 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  38.64 
 
 		 81 aa  40  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  38.3 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  38.64 
 
 		 81 aa  40  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  38.64 
 
 		 81 aa  40  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  38.64 
 
 		 81 aa  40  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  38.64 
 
 		 81 aa  40  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  38.3 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  38.3 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  38.3 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  38.3 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  38.3 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  38.3 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  38.64 
 
 		 81 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  41.3 
 
 		 75 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>