34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1689 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1689  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  346  7e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000692743  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01340  hypothetical protein  76.73 
 
 		 167 aa  261  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004125  hypothetical protein  76.1 
 
 		 167 aa  259  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000493845  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0834  hypothetical protein  59.09 
 
 		 154 aa  199  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5023  hypothetical protein  48.65 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5198  hypothetical protein  45.27 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5258  hypothetical protein  45.27 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68970  hypothetical protein  43.87 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5105  hypothetical protein  45.21 
 
 		 160 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0979763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5965  hypothetical protein  44.52 
 
 		 160 aa  148  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5432  hypothetical protein  40.38 
 
 		 161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1855  hypothetical protein  45.33 
 
 		 164 aa  139  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1255  hypothetical protein  44.59 
 
 		 179 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.641108  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2917  hypothetical protein  41.78 
 
 		 150 aa  137  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.389629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2166  hypothetical protein  40.38 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1327  hypothetical protein  42.47 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01871  lipoprotein, putative  43.06 
 
 		 223 aa  128  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0956  hypothetical protein  40.88 
 
 		 141 aa  127  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2058  hypothetical protein  43.36 
 
 		 165 aa  124  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2397  hypothetical protein  41.5 
 
 		 152 aa  124  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1551  hypothetical protein  37.42 
 
 		 171 aa  117  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147627  hitchhiker  0.00645173 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2318  hypothetical protein  36.67 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.701978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2015  hypothetical protein  36.67 
 
 		 185 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00179761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1802  hypothetical protein  37.32 
 
 		 174 aa  107  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0090  hypothetical protein  39.44 
 
 		 176 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00290  hypothetical protein  40.28 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3579  hypothetical protein  39.29 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0513  hypothetical protein  35.97 
 
 		 172 aa  104  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00777462  normal  0.634393 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1465  hypothetical protein  34.48 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3511  hypothetical protein  39.42 
 
 		 163 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45413  predicted protein  32.87 
 
 		 175 aa  96.7  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000791095  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0975  hypothetical protein  34.72 
 
 		 157 aa  94  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.149641  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2158  translation elongation factor P (EF-P)  32.88 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.401757  normal  0.635134 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1439  hypothetical protein  28.41 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>