45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1503 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1503  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  183  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356233  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003022  membrane protein  75.71 
 
 
98 aa  85.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000951308  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2223  inner membrane protein  53.01 
 
 
94 aa  84.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000112515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02858  hypothetical protein  72.86 
 
 
97 aa  84.3  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1734  protein of unknown function DUF1049  41.98 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000818234  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1621  hypothetical protein  40.24 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000478704  decreased coverage  6.99573e-22 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1440  hypothetical protein  40.24 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568816  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1838  hypothetical protein  40.24 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00855193  hitchhiker  0.000200494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1896  hypothetical protein  40.24 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00137818  hitchhiker  2.4531500000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1833  hypothetical protein  40.24 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00320514  unclonable  4.904429999999999e-31 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2189  hypothetical protein  41.46 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000588591  hitchhiker  0.0000414768 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01267  hypothetical protein  40.24 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000287085  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1507  hypothetical protein  40.24 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000188419  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1850  hypothetical protein  40.24 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000437894  unclonable  2.67694e-21 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2347  hypothetical protein  40.24 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000010556  unclonable  0.00000001629 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2642  protein of unknown function DUF1049  40 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000164462  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1481  hypothetical protein  40.24 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000597694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1390  hypothetical protein  40.24 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000611477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2368  protein of unknown function DUF1049  40.24 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  6.48025e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01256  conserved inner membrane protein  40.24 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000209793  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1913  hypothetical protein  40.24 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000266847  unclonable  1.58783e-24 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2368  hypothetical protein  38.27 
 
 
101 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00228618  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1956  hypothetical protein  36.17 
 
 
109 aa  53.5  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000544171  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2651  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  52.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000305401  unclonable  0.0000000305999 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2233  hypothetical protein  36.99 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000193542  hitchhiker  0.00232657 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2027  hypothetical protein  36.99 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000138978  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2313  hypothetical protein  37.23 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000179262  hitchhiker  0.000000295162 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1916  hypothetical protein  36.99 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000039637  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2296  hypothetical protein  39.33 
 
 
96 aa  51.2  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000100434  unclonable  0.0000000000669948 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1701  protein of unknown function DUF1049  32.94 
 
 
101 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000446702  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3011  hypothetical protein  40.98 
 
 
95 aa  50.4  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000562195  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2075  hypothetical protein  36.84 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000613824  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2121  hypothetical protein  38.16 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000851455  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2400  hypothetical protein  42.86 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2277  hypothetical protein  34.62 
 
 
91 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000908529  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0299  hypothetical protein  34.29 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2068  protein of unknown function DUF1049  33.72 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000063154  unclonable  0.00000000000136628 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1926  hypothetical protein  46.34 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000617351  unclonable  0.000000000024862 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2052  hypothetical protein  46.34 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000167533  unclonable  0.0000224709 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1979  hypothetical protein  46.34 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000259303  unclonable  0.0000000000385567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2072  hypothetical protein  34.62 
 
 
91 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000244541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2394  hypothetical protein  34.62 
 
 
91 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000269455  unclonable  0.00000827601 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2040  hypothetical protein  45.65 
 
 
91 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000897334  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1738  membrane protein  35.44 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000154763  hitchhiker  0.00236819 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1755  hypothetical protein  33.71 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>