27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0708 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0708  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 118 aa  231  2.0000000000000002e-60  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  33.72 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  32.58 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  31.25 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  37.5 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  31.58 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  35.94 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  32.08 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2390  ribonuclease P protein component  29.35 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102633  hitchhiker  0.0000000753131 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5052  ribonuclease P protein component  36.96 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107995  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  29.73 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  34.38 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  34.38 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  27.68 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  33.75 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  28.57 
 
 		 117 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  32.81 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2413  ribonuclease P protein component  22.22 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0343106  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4248  ribonuclease P  30.67 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000157593  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  30.67 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135  ribonuclease P  26.09 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000166605  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  34.07 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  30 
 
 		 118 aa  40  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  28.75 
 
 		 107 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>