72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0574 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0574  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0019  tRNA-Arg  91.43 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0224429  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0014  tRNA-Arg  89.39 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0054104  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0003  tRNA-Arg  97.62 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0048  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00527947  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0022  tRNA-Arg  89.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000027529  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0044  tRNA-Arg  87.14 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0063  tRNA-Arg  87.14 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.257054  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0020  tRNA-Arg  89.47 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0070  tRNA-Arg  89.47 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0135947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0050  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000344943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0023  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.157994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0062  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0111  tRNA-Arg  89.47 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0080  tRNA-Arg  89.47 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0053  tRNA-Arg  90.38 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376557  hitchhiker  8.69297e-22 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  85.71 
 
 
80 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000523953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5664  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000049458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0051  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0299  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000767893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0100  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00184606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0051  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5672  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0014  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000388984  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  85.71 
 
 
80 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000012583  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000072092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5044  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277575  normal 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  85.71 
 
 
80 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000143078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0014  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000281617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0277  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5028  tRNA-Arg  87.72 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000552339  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0046  tRNA-Arg  92.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0026  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4997  tRNA-Arg  87.72 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0785  tRNA-Arg  87.72 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.40314e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0101  tRNA-Arg  87.72 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00157662  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0860  tRNA-Arg  87.72 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000046411  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0037  tRNA-Arg  92.68 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5639  tRNA-Arg  87.72 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4571  tRNA-Arg  87.72 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000605128  normal  0.110688 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5732  tRNA-Arg  87.72 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5813  tRNA-Arg  87.72 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0218  tRNA-Arg  87.72 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000264905  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0056  tRNA-Arg  87.72 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000123447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000201078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000407513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  87.72 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  87.72 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000500778  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000847547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000219464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5726  tRNA-Arg  87.72 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000859141  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0056  tRNA-Arg  87.72 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.771364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0024  tRNA-Arg  87.72 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0232798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0133  tRNA-Arg  87.72 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000990226  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5694  tRNA-Arg  87.72 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000635784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0137  tRNA-Arg  87.72 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00346099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0024  tRNA-Arg  87.72 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0104  tRNA-Arg  87.72 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527432  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0032  tRNA-Arg  86.21 
 
 
74 bp  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0084  tRNA-Arg  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000144766  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t32  tRNA-Arg  84.85 
 
 
77 bp  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0011176  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  84.29 
 
 
77 bp  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000884624  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  85.96 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0053  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0223382  normal  0.521756 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1223  tRNA-Arg  84.48 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0782259  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0008  tRNA-Arg  86 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119735  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0009  tRNA-Arg  86 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.190028  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2137  tRNA-Arg  82.86 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2212  tRNA-Arg  82.86 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.249062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>