More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0225 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0225  30S ribosomal protein S10  100 
 
 
101 aa  203  7e-52  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  unclonable  0.00000196504  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  59 
 
 
102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  57 
 
 
102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 
102 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  56 
 
 
102 aa  123  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  56.57 
 
 
103 aa  122  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  54.55 
 
 
102 aa  121  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  54 
 
 
103 aa  120  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10030  SSU ribosomal protein S10P  51 
 
 
102 aa  120  8e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000017716  hitchhiker  0.00000000188362 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0961  ribosomal protein S10  51 
 
 
102 aa  120  8e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000260411  hitchhiker  0.000000000152054 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2712  ribosomal protein S10  53.54 
 
 
102 aa  120  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000160608  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  55.56 
 
 
102 aa  120  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
102 aa  120  9e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0874  ribosomal protein S10  54 
 
 
103 aa  119  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.522199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  55 
 
 
103 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2965  30S ribosomal protein S10  55 
 
 
102 aa  119  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118126  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2715  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 
102 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000442606  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2400  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 
102 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028025  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  55 
 
 
102 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0393  30S ribosomal protein S10  52 
 
 
105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0368  30S ribosomal protein S10  52 
 
 
105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  118  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  51 
 
 
107 aa  118  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0859  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
109 aa  118  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.591238  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0453  30S ribosomal protein S10  52 
 
 
103 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0704355  unclonable  0.000000189493 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0625  ribosomal protein S10  52 
 
 
103 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000000466292  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0486  30S ribosomal protein S10  52 
 
 
103 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000131122  normal  0.0380301 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4549  30S ribosomal protein S10  52 
 
 
103 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000213954  normal  0.0597614 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1395  30S ribosomal protein S10  52 
 
 
102 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00721101  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2325  30S ribosomal protein S10  54 
 
 
104 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00118497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5080  30S ribosomal protein S10  52 
 
 
103 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793453  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4750  30S ribosomal protein S10  52 
 
 
103 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000671466  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1291  30S ribosomal protein S10  52 
 
 
102 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
102 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3752  SSU ribosomal protein S10P  54 
 
 
103 aa  117  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000621266  hitchhiker  0.0036093 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  53.54 
 
 
104 aa  118  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0483  30S ribosomal protein S10  52 
 
 
103 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000151275  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4318  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000242072  unclonable  0.0000000000477389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  52 
 
 
102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4691  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000838307  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0183  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140291  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  52 
 
 
102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08840  30S ribosomal protein S10  52 
 
 
103 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000352676  normal  0.0199275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0836  30S ribosomal protein S10  52 
 
 
103 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0236552  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0707  30S ribosomal protein S10  51 
 
 
105 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
102 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3745  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00135486  normal  0.0277892 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0322  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  117  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000012719  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3823  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  117  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000546327  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
102 aa  117  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
102 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4002  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  117  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000661379  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3637  ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000269105  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0282  ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  117  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000746506  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
102 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0404  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  117  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0007092  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
102 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
102 aa  117  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3808  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000064612  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4545  ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  117  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000155488  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3916  ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  117  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.06232e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0058  SSU ribosomal protein S10P  53 
 
 
103 aa  117  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000415336  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0583  ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  117  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572032  normal  0.180599 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3710  ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000120586  normal  0.692874 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3637  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000584006  normal  0.459498 
 
 
-
 
NC_002620  TC0720  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 
105 aa  117  7e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0939005  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0420  SSU ribosomal protein S10P  51 
 
 
103 aa  117  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00124832  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1353  30S ribosomal protein S10  54 
 
 
102 aa  117  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.777643  normal  0.0177608 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0457  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  117  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403688  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1947  30S ribosomal protein S10  54 
 
 
102 aa  117  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  52 
 
 
102 aa  117  7e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0212  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  117  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000277123  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3910  30S ribosomal protein S10  51 
 
 
103 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00375138  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06240  30S ribosomal protein S10  51 
 
 
103 aa  116  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00394017  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0169  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000585443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1085  30S ribosomal protein S10  50 
 
 
102 aa  117  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  54 
 
 
103 aa  117  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl122  30S ribosomal protein S10  51 
 
 
102 aa  116  9e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  5.36997e-55  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2841  30S ribosomal protein S10  52 
 
 
103 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000513436  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4171  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000385608  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1832  30S ribosomal protein S10  51.52 
 
 
102 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000860395  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0581  30S ribosomal protein S10  54 
 
 
102 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0230  30S ribosomal protein S10  52 
 
 
103 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2319  30S ribosomal protein S10  51.52 
 
 
102 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000523033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0199  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000181945  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05710  30S ribosomal protein S10  53.47 
 
 
101 aa  116  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.751469  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0318  30S ribosomal protein S10  52 
 
 
103 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.1858999999999998e-21  hitchhiker  0.0000342143 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4057  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000379961  hitchhiker  0.000000000138432 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0157  30S ribosomal protein S10  52 
 
 
103 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000255753  decreased coverage  0.0000448668 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2278  30S ribosomal protein S10  51.52 
 
 
102 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000204136  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0195  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000645818  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3760  30S ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000001631  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0313  30S ribosomal protein S10  52 
 
 
103 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000233009  normal  0.0207604 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3645  30S ribosomal protein S10  52 
 
 
103 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000475308  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  49 
 
 
102 aa  116  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0198  30S ribosomal protein S10  52 
 
 
103 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000200655  unclonable  0.0000000000157318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0193  30S ribosomal protein S10  52 
 
 
103 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000424599  decreased coverage  0.00027939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0198  30S ribosomal protein S10  52 
 
 
103 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000267319  hitchhiker  0.0000000013297 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3906  30S ribosomal protein S10  50 
 
 
102 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3525  ribosomal protein S10  53 
 
 
103 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000457129  hitchhiker  0.0000321241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>