176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0223 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0223  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 64 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.0000237579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  60 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  60 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  60 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  60 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  60 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  60 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  60 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  60 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  60 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  60 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  60 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1408  50S ribosomal protein L35  56.67 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.62666e-18  unclonable  7.5203e-29 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  53.33 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  53.33 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1254  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00450085  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf193  50S ribosomal protein L35  51.72 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000550484  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl189  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172022  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1202  50S ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750634  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0204  50S ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 63 aa  51.6  0.000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2623  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  53.45 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  53.45 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1822  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000837501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1714  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406642  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2032  50S ribosomal protein L35  54.55 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000178716  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  51.72 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1343  ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  50.1  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000164157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  46.43 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1383  50S ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000504728  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  44.83 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  45 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  49.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  47.37 
 
 		 65 aa  48.9  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  46.55 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  44.83 
 
 		 65 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  43.1 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  49.12 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  43.1 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1088  50S ribosomal protein L35  49.09 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000177578  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01686  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0100016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1925  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359648  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1838  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121921  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1446  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1915  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414534  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01675  hypothetical protein  46.88 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0162765  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2435  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000580293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1463  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.3269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2010  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.800044 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1959  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000143205  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  41.67 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1430  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000901433  normal  0.0165189 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1474  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0002542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1798  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000060614  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  45 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2502  ribosomal protein L35  40 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  46.55 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  47.17 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  45 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  45 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  45 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000771602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3521  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0090517  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  40 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  42.19 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  43.33 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1279  50S ribosomal protein L35P  41.67 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.686056  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2768  50S ribosomal protein L35  54.55 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2641  50S ribosomal protein L35  54.55 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  42.31 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  48.21 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28670  50S ribosomal protein L35  45 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000017021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  45 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  43.4 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1240  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000491229  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  40.98 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  42.31 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  44.23 
 
 		 65 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  44.23 
 
 		 65 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>