More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1382 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1382  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  100 
 
 
308 aa  618  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000550702  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1428  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  97.06 
 
 
306 aa  599  1e-170  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.137055  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0103  phosphoglycerate dehydrogenase  67.67 
 
 
303 aa  425  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0112  phosphoglycerate dehydrogenase  70 
 
 
303 aa  419  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1821  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  52.81 
 
 
523 aa  308  9e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0835  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  52.48 
 
 
523 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1082  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  52.48 
 
 
523 aa  305  6e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0567  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  51.82 
 
 
523 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0258  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  51.15 
 
 
310 aa  300  3e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.325907  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0900  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  49.83 
 
 
523 aa  293  2e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2506  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  49.34 
 
 
528 aa  289  4e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000305441 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  51.8 
 
 
527 aa  287  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155189  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1421  Phosphoglycerate dehydrogenase  53.11 
 
 
304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1089  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  52.33 
 
 
526 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150639  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0967  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  50.67 
 
 
526 aa  282  6.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1850  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  49.84 
 
 
527 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1520  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  50.49 
 
 
526 aa  282  6.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0002199  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2650  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  50.84 
 
 
528 aa  281  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1543  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  49.18 
 
 
527 aa  280  2e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00623773  hitchhiker  0.0000362163 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2694  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  51.05 
 
 
528 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2601  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  51.05 
 
 
528 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159181  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0439  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.23 
 
 
532 aa  275  7e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0587451  normal  0.906143 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1262  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  50.7 
 
 
528 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0039  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  48.53 
 
 
525 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00530837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0014  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  48.68 
 
 
526 aa  271  7e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744014  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2164  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.56 
 
 
534 aa  271  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2852  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.71 
 
 
527 aa  271  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00180336  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0616  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.91 
 
 
528 aa  267  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3161  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  49.67 
 
 
532 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0012  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.2 
 
 
526 aa  267  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.578759  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1352  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.7 
 
 
534 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0020  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.7 
 
 
531 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2618  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  48.37 
 
 
531 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.497758  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3192  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.35 
 
 
531 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2377  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.83 
 
 
525 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2428  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.83 
 
 
525 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0896  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  49.45 
 
 
527 aa  263  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.643854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1018  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  49.45 
 
 
527 aa  263  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000612711 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3486  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.35 
 
 
531 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.158391 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2813  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.23 
 
 
532 aa  263  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3100  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  48.9 
 
 
525 aa  262  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.659114 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3595  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.18 
 
 
531 aa  261  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.86096  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3649  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.38 
 
 
526 aa  262  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0277903  normal  0.752498 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4778  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.16 
 
 
527 aa  261  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.801669 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1423  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  49.26 
 
 
527 aa  261  8e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.37 
 
 
531 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.570425  hitchhiker  0.00544887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2856  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.04 
 
 
528 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1436  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  45.9 
 
 
524 aa  261  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3021  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.21 
 
 
531 aa  260  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0814  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.37 
 
 
529 aa  259  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119542  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3375  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.38 
 
 
652 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4340  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.55 
 
 
526 aa  258  7e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0786  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.74 
 
 
527 aa  258  8e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1685  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.71 
 
 
533 aa  258  9e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.447631  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1629  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.71 
 
 
533 aa  258  9e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1315  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.41 
 
 
529 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1231  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  49.47 
 
 
529 aa  257  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.325344  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2968  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.08 
 
 
529 aa  256  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1229  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.71 
 
 
533 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270378  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4789  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.73 
 
 
529 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3620  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.53 
 
 
525 aa  256  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.737909  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4685  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.51 
 
 
525 aa  256  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0020  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  51.52 
 
 
525 aa  255  6e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.173691  hitchhiker  0.000002432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3318  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.39 
 
 
531 aa  255  6e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.677421  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0261  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.36 
 
 
531 aa  255  7e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1224  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  45 
 
 
523 aa  255  7e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3063  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.26 
 
 
528 aa  254  9e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.737613  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2680  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  45.42 
 
 
540 aa  254  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3905  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.56 
 
 
529 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2138  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46 
 
 
525 aa  253  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1826  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.06 
 
 
529 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_002936  DET0599  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  45 
 
 
526 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0013465  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0574  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  45 
 
 
526 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2306  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  45.6 
 
 
531 aa  252  7e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.551653  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08910  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.67 
 
 
531 aa  252  7e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3759  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  45.15 
 
 
526 aa  251  8.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000435115  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1119  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.41 
 
 
529 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1501  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.04 
 
 
546 aa  250  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4106  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.08 
 
 
529 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.885327  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2385  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  45.54 
 
 
523 aa  250  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.917938  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2197  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.74 
 
 
525 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000367655  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1084  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.55 
 
 
524 aa  250  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3521  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44 
 
 
529 aa  250  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.598848  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_539  phosphoglycerate dehydrogenase  44.33 
 
 
526 aa  250  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.366241  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4467  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.2 
 
 
526 aa  249  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0468875  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2378  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.09 
 
 
541 aa  250  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0367603  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4196  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.67 
 
 
527 aa  249  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1873  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  48.9 
 
 
526 aa  249  4e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847931 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1760  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.69 
 
 
531 aa  249  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1198  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.42 
 
 
542 aa  248  9e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0190635  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0837  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  45.72 
 
 
527 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746889  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2156  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.15 
 
 
526 aa  247  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1737  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.11 
 
 
541 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1431  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  45.48 
 
 
523 aa  246  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0875304 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0432  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  45.18 
 
 
524 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0263  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.57 
 
 
524 aa  246  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.03617 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13011  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  48.89 
 
 
528 aa  246  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000841945  normal  0.820914 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1288  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.28 
 
 
531 aa  245  6.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.605181  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6798  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.26 
 
 
531 aa  245  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.902777  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2694  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.72 
 
 
534 aa  244  9e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.835584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>