22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1052 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1060  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  228  3e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1052  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  228  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0846  hypothetical protein  37.5 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0095  hypothetical protein  41 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1003  hypothetical protein  30.3 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1344  protein of unknown function DUF322  34.58 
 
 
119 aa  47.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.635847  normal  0.332386 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2079  alkaline shock protein  41.51 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102163  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1793  alkaline shock protein  41.51 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0585534  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1186  hypothetical protein  26.92 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00330637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1186  hypothetical protein  27.78 
 
 
277 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0697  hypothetical protein  28.3 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0226225  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3838  protein of unknown function DUF322  37.25 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.55923e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  27.5 
 
 
149 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1704  hypothetical protein  31.82 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1986  hypothetical protein  31.82 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1138  protein of unknown function DUF322  30.56 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000668852  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1782  alkaline shock protein 23  24.39 
 
 
166 aa  40.8  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.369118  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0290  protein of unknown function DUF322  28.3 
 
 
158 aa  40.4  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.502178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1164  hypothetical protein  32.79 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000269961  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4065  protein of unknown function DUF322  28.18 
 
 
155 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2213  alkaline shock protein 23  25.66 
 
 
169 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2252  alkaline shock protein 23  25.66 
 
 
169 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.795316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>