63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1035 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1085  ribonuclease III  100 
 
 		 140 aa  286  5.0000000000000004e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1035  ribonuclease III  100 
 
 		 140 aa  286  5.0000000000000004e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0700  ribonuclease III  43.36 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0597  hypothetical protein  41.03 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2061  hypothetical protein  36.97 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3321  ribonuclease III  38.33 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000186185  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2354  hypothetical protein  41.07 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34376  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0054  ribonuclease III  44.14 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0917731  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0172  ribonuclease III  41.13 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000401793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1940  ribonuclease III  38.89 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.695553  normal  0.347007 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0266  ribonuclease III  35.83 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000768224  normal  0.0115191 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00970  ribonuclease III  39.09 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206089  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3323  ribonuclease III  31.36 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.545718  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0118  hypothetical protein  38.05 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2049  ribonuclease III  33.33 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000924659  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0194  ribonuclease III  35 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0360608  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2425  ribonuclease III  39.09 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3685  ribonuclease III  39.09 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.449884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0087  ribonuclease III  35.9 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0567  hypothetical protein  33.06 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3194  ribonuclease III  37.27 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139584 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0553  hypothetical protein  33.06 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4412  ribonuclease III  35.96 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0339  hypothetical protein  33.87 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000203388  hitchhiker  0.000000343763 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0171  hypothetical protein  34.19 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.241857  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2483  ribonuclease III  30.51 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000130783  normal  0.0178279 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2731  ribonuclease III  33.04 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2312  ribonuclease III  35.9 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.918616  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1823  ribonuclease III family protein  36.11 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2736  hypothetical protein  33.05 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1426  ribonuclease III family protein  37.96 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000290705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2422  hypothetical protein  33.05 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.477088  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2284  ribonuclease III  33.05 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.445322  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0208  hypothetical protein  33.94 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0847  hypothetical protein  32.95 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374765  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0850  hypothetical protein  37.38 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0091  ribonuclease III  34.19 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000109584  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09091  hypothetical protein  37.61 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0399  ribonuclease III  36.27 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0085  hypothetical protein  32.48 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000804774  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09111  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.812388  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09301  hypothetical protein  28.1 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0249476 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15791  hypothetical protein  37.27 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1305  hypothetical protein  34.78 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10321  hypothetical protein  33.61 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.730053  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0261  hypothetical protein  28.1 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2042  ribonuclease III family protein  31.9 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0085  ribonuclease III  30.89 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.46597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5215  hypothetical protein  31.11 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527378  unclonable  5.1229600000000003e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0090  hypothetical protein  31.11 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0087  hypothetical protein  31.11 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0086  hypothetical protein  31.11 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0111  hypothetical protein  31.11 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0092222  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0090  hypothetical protein  31.11 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000630531  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0101  hypothetical protein  31.11 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.28353e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0121  hypothetical protein  31.11 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000631862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0090  hypothetical protein  31.11 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0851782  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1154  hypothetical protein  32.77 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.784455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0304  ribonuclease III  32.2 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000121924  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13944  predicted protein  33.03 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06951  hypothetical protein  34.68 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.056315  normal  0.0999203 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2120  ribonuclease III  35.92 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35651  predicted protein  29.6 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0106651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>