59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0133 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0133  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 270 aa  555  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0041  ribokinase-like domain-containing protein  39.57 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0726118  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  25.47 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  29.9 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  25.74 
 
 		 298 aa  52.4  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  24.15 
 
 		 315 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  24.15 
 
 		 315 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  35.87 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  25 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  24.64 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0083  ribokinase-like domain-containing protein  29.46 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  28.22 
 
 		 299 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  39.13 
 
 		 309 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  24.64 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  24.64 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  36.23 
 
 		 362 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  36.23 
 
 		 362 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  36.23 
 
 		 362 aa  46.2  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  36.23 
 
 		 362 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  39.66 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  36.23 
 
 		 362 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  36.23 
 
 		 362 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  36.23 
 
 		 362 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  36.23 
 
 		 362 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  26.85 
 
 		 328 aa  45.8  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  33.78 
 
 		 315 aa  45.8  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0652  PfkB domain-containing protein  24.77 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  24.5 
 
 		 380 aa  45.4  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  33.78 
 
 		 315 aa  45.4  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  53.49 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  24.28 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  24.28 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  24.91 
 
 		 298 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  24.28 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  24.52 
 
 		 363 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  24.37 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  33.33 
 
 		 339 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  53.49 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  53.49 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  46.67 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  24.35 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1010  ribokinase-like domain-containing protein  23.9 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  26.62 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  26.32 
 
 		 302 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  36.21 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  21.55 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  21.55 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  21.55 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  21.55 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  21.55 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  30 
 
 		 323 aa  43.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  28.57 
 
 		 309 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  26.34 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  24.54 
 
 		 298 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  24.82 
 
 		 287 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  28.57 
 
 		 309 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  21.58 
 
 		 319 aa  42.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_618  sugar kinase ribokinase  26.17 
 
 		 328 aa  42.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  28.69 
 
 		 321 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>