128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1529 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1529  major facilitator transporter  100 
 
 
394 aa  762    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.324526  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  25.76 
 
 
398 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0291  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 
415 aa  61.6  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  25.66 
 
 
398 aa  60.1  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  24.55 
 
 
411 aa  58.5  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  25.09 
 
 
403 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  25.36 
 
 
423 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  28.03 
 
 
407 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  23.81 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 
403 aa  53.5  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  23.62 
 
 
401 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  21.91 
 
 
396 aa  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  26.64 
 
 
412 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.84 
 
 
519 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2213  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
428 aa  50.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.175074  decreased coverage  0.00000120086 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 
410 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  26.5 
 
 
406 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  20.08 
 
 
387 aa  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  25.26 
 
 
408 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  25.26 
 
 
406 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  23.38 
 
 
406 aa  49.7  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  25.26 
 
 
408 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  25.26 
 
 
408 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  25.26 
 
 
408 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  25.26 
 
 
408 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  25.26 
 
 
408 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 
406 aa  49.7  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  26.15 
 
 
406 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  22.96 
 
 
392 aa  49.7  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  27.58 
 
 
385 aa  49.7  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  20.31 
 
 
387 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  25.09 
 
 
408 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.41 
 
 
505 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.36 
 
 
474 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  25.63 
 
 
406 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.27 
 
 
509 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  25.63 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  24.14 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  25 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  30.83 
 
 
490 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  27.27 
 
 
515 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  23.42 
 
 
410 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  21.93 
 
 
388 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  24.58 
 
 
400 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  24.73 
 
 
402 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  21.25 
 
 
402 aa  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.35 
 
 
512 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  24.73 
 
 
402 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  25.93 
 
 
426 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  23.93 
 
 
402 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.62 
 
 
526 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0357  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 
431 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 
417 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  24.29 
 
 
417 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 
417 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 
417 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 
417 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5244  major facilitator superfamily transporter  26.76 
 
 
513 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  23.66 
 
 
402 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 
423 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4365  major facilitator transporter  29.91 
 
 
406 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0313  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.44 
 
 
531 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00303369  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 
422 aa  47  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  25.97 
 
 
501 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  20.05 
 
 
406 aa  46.6  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  21.4 
 
 
446 aa  46.6  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  21.56 
 
 
400 aa  46.6  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  25.63 
 
 
406 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  25.63 
 
 
406 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  25.63 
 
 
406 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  26.57 
 
 
444 aa  46.2  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3269  major facilitator family transporter  33.96 
 
 
481 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.71 
 
 
498 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0403  major facilitator family transporter  33.96 
 
 
537 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 
434 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2933  major facilitator family transporter  33.96 
 
 
429 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2156  major facilitator family transporter  33.96 
 
 
429 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36589  transport protein  27.19 
 
 
570 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.169894  normal  0.209561 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0208  major facilitator family transporter  33.96 
 
 
428 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0220  major facilitator family transporter  33.96 
 
 
429 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3414  major facilitator family transporter  33.96 
 
 
429 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  29.39 
 
 
422 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  23.13 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.6 
 
 
536 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 
404 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.93 
 
 
525 aa  46.2  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  23.94 
 
 
406 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.71 
 
 
504 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  22.59 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  28 
 
 
405 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.43 
 
 
520 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35133  major facilitator superfamily multidrug-resistance protein  23.66 
 
 
489 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.446888  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  20.62 
 
 
410 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  23.23 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  22.58 
 
 
406 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 
522 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06063  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08910)  27.43 
 
 
479 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.06 
 
 
530 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  29.03 
 
 
449 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.34 
 
 
521 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>