135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1303 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1303  major facilitator transporter  100 
 
 
395 aa  754    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0834796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  25.57 
 
 
384 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  24.23 
 
 
390 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  24.44 
 
 
390 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  24.44 
 
 
390 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  24.44 
 
 
390 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  23.94 
 
 
392 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  24.93 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  23.94 
 
 
390 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  24.01 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  23.73 
 
 
384 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  23.45 
 
 
384 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  29.26 
 
 
410 aa  63.9  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 
410 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  25.54 
 
 
389 aa  61.2  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1385  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.22 
 
 
519 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.22 
 
 
519 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0184869 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.14 
 
 
519 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0707168 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.59 
 
 
510 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0468025  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  23.63 
 
 
411 aa  53.1  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  25.87 
 
 
404 aa  53.1  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  27.66 
 
 
381 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  25.78 
 
 
426 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.84 
 
 
519 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.84 
 
 
519 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.84 
 
 
519 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 
397 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.74 
 
 
519 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.74 
 
 
519 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.74 
 
 
519 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  26.95 
 
 
381 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.74 
 
 
519 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.74 
 
 
519 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.74 
 
 
519 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.74 
 
 
519 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.74 
 
 
519 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  27.51 
 
 
406 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  28.8 
 
 
395 aa  50.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0877  major facilitator superfamily MFS_1  23.59 
 
 
458 aa  50.8  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  31.68 
 
 
386 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 
489 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.22 
 
 
531 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 
403 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  27.44 
 
 
403 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 
403 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 
403 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  26.39 
 
 
381 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  27.66 
 
 
381 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  26.39 
 
 
381 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  22.87 
 
 
407 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 
395 aa  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  28.93 
 
 
397 aa  49.7  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  27.66 
 
 
381 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  24.69 
 
 
408 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 
408 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  23.3 
 
 
381 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 
453 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.47 
 
 
519 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  24.69 
 
 
408 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  25.79 
 
 
410 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  26.04 
 
 
410 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  24.69 
 
 
408 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  24.69 
 
 
408 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  24.37 
 
 
404 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  24.69 
 
 
408 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  24.37 
 
 
404 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  24.37 
 
 
404 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  24.37 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  26.95 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  24.37 
 
 
404 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  24.37 
 
 
404 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  34.86 
 
 
406 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  27.65 
 
 
411 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  25.44 
 
 
404 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  25.95 
 
 
404 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  22.67 
 
 
395 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  25.9 
 
 
384 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  25.9 
 
 
381 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  24.83 
 
 
370 aa  47.4  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  25.41 
 
 
404 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  25.41 
 
 
404 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.67 
 
 
511 aa  47.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  27.71 
 
 
390 aa  47  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  26.53 
 
 
391 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  25.41 
 
 
404 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  25.75 
 
 
404 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  25.75 
 
 
404 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  29.84 
 
 
405 aa  46.2  0.0009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1129  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  24.57 
 
 
525 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943729  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 
504 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2022  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.59 
 
 
520 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00497968 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 
397 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 
385 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1322  major facilitator superfamily transporter  29.79 
 
 
457 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 
387 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  24.86 
 
 
404 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  34 
 
 
398 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5530  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.14 
 
 
543 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214437  normal  0.30089 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>