14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1279 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1279  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 252 aa  510  1e-144  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  42.25 
 
 		 615 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4340  hypothetical protein  25.95 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0288249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2096  hypothetical protein  22.8 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  29.25 
 
 		 626 aa  52.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  44.64 
 
 		 566 aa  52.8  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3462  hypothetical protein  21.86 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00892274 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0587  hypothetical protein  24.08 
 
 		 201 aa  49.7  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0839673  hitchhiker  0.000680338 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1324  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.07 
 
 		 240 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.711036  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0351  hypothetical protein  22.95 
 
 		 219 aa  45.8  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3144  hypothetical protein  22.98 
 
 		 356 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.985992  normal  0.0165382 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1874  hypothetical protein  25 
 
 		 206 aa  43.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  26.97 
 
 		 590 aa  42.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0923  PUA domain containing protein  29.09 
 
 		 497 aa  42.4  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>