12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1261 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1261  Alba, DNA/RNA-binding protein  100 
 
 		 95 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0211  DNA-binding protein Alba  48.78 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.989773  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0535  DNA-binding protein Alba  38.82 
 
 		 93 aa  52.8  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0019  DNA-binding protein Alba  39.29 
 
 		 90 aa  53.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1940  DNA-binding protein Alba  40.7 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.13078  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1747  DNA/RNA-binding protein albA  47.37 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.597618  normal  0.398365 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1656  DNA-binding protein Alba  37.35 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1396  DNA/RNA-binding protein albA  35.71 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0857  DNA/RNA-binding protein albA  34.52 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0947  DNA/RNA-binding protein albA  34.52 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1922  DNA/RNA-binding protein albA  33.33 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.511261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1496  DNA/RNA-binding protein albA  35.29 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.930006  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>