17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0865 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0865  beta-lactamase superfamily hydrolase  100 
 
 
235 aa  467  1.0000000000000001e-131  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  31.97 
 
 
272 aa  63.9  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 
229 aa  62.4  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  24.31 
 
 
278 aa  52  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0500  beta-lactamase domain protein  24.16 
 
 
264 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.977246  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1747  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 
275 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 
218 aa  49.7  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1774  beta-lactamase domain-containing protein  28.39 
 
 
221 aa  48.9  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  31.91 
 
 
294 aa  47  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 
327 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3932  beta-lactamase domain protein  33.65 
 
 
276 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0238376 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1129  beta-lactamase domain-containing protein  27.82 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000396645  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3848  beta-lactamase domain protein  34 
 
 
276 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0515  beta-lactamase domain-containing protein  21.22 
 
 
284 aa  43.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0268037  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1430  Beta-lactamase-like  22.56 
 
 
280 aa  42.7  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186428  normal  0.102633 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  26.02 
 
 
218 aa  42  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>