44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2639 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2639  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 99 aa  189  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.225894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2877  hypothetical protein  54.12 
 
 		 95 aa  98.6  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1413  hypothetical protein  59.21 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0918909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2920  protein of unknown function YGGT  53.75 
 
 		 96 aa  90.1  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00113152  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0904  protein of unknown function YGGT  46.24 
 
 		 95 aa  87.8  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00960363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2995  hypothetical protein  50.59 
 
 		 97 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.133667 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3192  hypothetical protein  48.84 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1578  protein of unknown function YGGT  53.73 
 
 		 95 aa  84  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.103365 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3311  hypothetical protein  48.81 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0475182 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3249  hypothetical protein  48.81 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2404  protein of unknown function YGGT  45.68 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.492904 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3260  hypothetical protein  48.81 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0615606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1117  hypothetical protein  50.67 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.12614  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5756  protein of unknown function YGGT  61.02 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3010  protein of unknown function YGGT  44.57 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3516  hypothetical protein  49.4 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393311  normal  0.0621678 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1577  hypothetical protein  50 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123124  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12176  transmembrane protein  45.24 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.691227 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27330  YGGT family protein  55.56 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16500  YGGT family protein  50 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.14322  normal  0.0963368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5090  hypothetical protein  46.34 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  hitchhiker  0.000638915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3255  protein of unknown function YGGT  49.3 
 
 		 99 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.676354  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1080  protein of unknown function YGGT  45.45 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22740  YGGT family protein  50.75 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.584515  normal  0.0326478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3056  hypothetical protein  49.35 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0864971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6100  protein of unknown function YGGT  47.89 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0776287 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0138  hemolysin-like protein  41.98 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0119341  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4005  hypothetical protein  41.76 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1290  protein of unknown function YGGT  48.39 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.735211  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1026  hypothetical protein  43.96 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.249686  decreased coverage  0.00177157 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1601  protein of unknown function YGGT  49.23 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.201823  normal  0.632427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10870  YGGT family protein  56.86 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0110241  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3795  protein of unknown function YGGT  49.09 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.261566  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13530  possible membrane protein  42.62 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.688244  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1422  hypothetical protein  43.33 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00134439  normal  0.136409 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1118  hypothetical protein  35.8 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.448589 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3207  hypothetical protein  43.64 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.40439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3433  hypothetical protein  43.64 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.500015  hitchhiker  0.00553581 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  32.97 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  34.48 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  31.87 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  31.87 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  32.98 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  32.98 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>