More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2499 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1806  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  79.61 
 
 
407 aa  643    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2499  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 
407 aa  821    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12802  acyl-CoA dehydrogenase fadE21  67.65 
 
 
410 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.234086  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2992  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  64.58 
 
 
415 aa  534  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal  0.0331169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2977  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  64.49 
 
 
412 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.898877  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3021  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  64.49 
 
 
412 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3537  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.05 
 
 
413 aa  533  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.195685  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2342  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.87 
 
 
418 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240439  decreased coverage  0.00232541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3323  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.11 
 
 
414 aa  520  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.562649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2337  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  59.9 
 
 
397 aa  486  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00222003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2622  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.44 
 
 
431 aa  309  4e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.84 
 
 
379 aa  215  9e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.48 
 
 
376 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  35.98 
 
 
376 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  35.98 
 
 
376 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  35.98 
 
 
381 aa  202  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  35.98 
 
 
376 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  35.98 
 
 
376 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  35.73 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  35.73 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  35.98 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  35.56 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.45 
 
 
379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.64 
 
 
376 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0802  isovaleryl-CoA dehydrogenase  35.06 
 
 
393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0542  isovaleryl-CoA dehydrogenase  35.06 
 
 
393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470015  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1608  isovaleryl-CoA dehydrogenase  35.06 
 
 
393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0654  isovaleryl-CoA dehydrogenase  35.06 
 
 
393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548122  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1959  putative isovaleryl-CoA dehydrogenase  35.06 
 
 
393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0471  isovaleryl-CoA dehydrogenase  35.06 
 
 
393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2056  putative isovaleryl-CoA dehydrogenase  35.06 
 
 
393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108299  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3018  Acyl-CoA dehydrogenase  33.5 
 
 
407 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4263  acyl-CoA dehydrogenase-like  33.76 
 
 
390 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  0.561312 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0960  isovaleryl-CoA dehydrogenase  34.05 
 
 
393 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433991  normal  0.388602 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.4 
 
 
379 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2739  acyl-CoA dehydrogenase, putative  33.42 
 
 
447 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3933  Acyl-CoA dehydrogenase-like  32.75 
 
 
390 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.91 
 
 
388 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0119178  unclonable  0.00000752707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34 
 
 
379 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  34 
 
 
379 aa  193  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1932  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.23 
 
 
380 aa  193  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2470  isovaleryl-CoA dehydrogenase  33.67 
 
 
387 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0293728  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.58 
 
 
388 aa  193  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4686  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.81 
 
 
393 aa  193  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162224  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3662  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.99 
 
 
387 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000131881 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  33.66 
 
 
380 aa  192  8e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3693  isovaleryl-CoA dehydrogenase  33 
 
 
390 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.34 
 
 
380 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1812  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.99 
 
 
387 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0871457  normal  0.415388 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.5 
 
 
402 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4064  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.99 
 
 
424 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  hitchhiker  0.0046695 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2318  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.26 
 
 
390 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.759089  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1777  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.99 
 
 
387 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0186488 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.98 
 
 
382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3562  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.05 
 
 
393 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0289  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.76 
 
 
391 aa  190  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0226098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3656  isovaleryl-CoA dehydrogenase  31.66 
 
 
387 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.179163  normal  0.0293073 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0356  isovaleryl-CoA dehydrogenase  33.5 
 
 
392 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.969667  decreased coverage  0.00000934354 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3466  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.48 
 
 
393 aa  189  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360992  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5121  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.24 
 
 
393 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975401  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  33.75 
 
 
379 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0947  isovaleryl-CoA dehydrogenase  33.83 
 
 
393 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4190  isovaleryl-CoA dehydrogenase  33.9 
 
 
393 aa  189  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3396  acyl-CoA dehydrogenase  38.92 
 
 
351 aa  188  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.581792  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  34.41 
 
 
379 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  34.41 
 
 
379 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1804  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.01 
 
 
390 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2121  isovaleryl-CoA dehydrogenase  31.99 
 
 
388 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.274166  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0423  isovaleryl-CoA dehydrogenase  33.99 
 
 
414 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.733872  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2106  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.25 
 
 
381 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38440  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  32.66 
 
 
387 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2188  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.49 
 
 
390 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1897  isovaleryl-CoA dehydrogenase  33.33 
 
 
389 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  34.07 
 
 
379 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1739  isovaleryl-CoA dehydrogenase  31.8 
 
 
390 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  31.53 
 
 
379 aa  187  4e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4588  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.24 
 
 
393 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5062  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.25 
 
 
387 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.09 
 
 
381 aa  186  5e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1226  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.41 
 
 
381 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2322  isovaleryl-CoA dehydrogenase  32.18 
 
 
389 aa  186  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.58 
 
 
374 aa  186  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3127  acyl-CoA dehydrogenase-like  33.99 
 
 
393 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105998  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5240  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.99 
 
 
393 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288959  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6658  isovaleryl-CoA dehydrogenase  32.99 
 
 
390 aa  186  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2925  isovaleryl-CoA dehydrogenase  34.74 
 
 
389 aa  186  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1672  isovaleryl-CoA dehydrogenase  32.18 
 
 
389 aa  186  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2394  isovaleryl-CoA dehydrogenase  32.18 
 
 
389 aa  186  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49560  Acyl-CoA dehydrogenase  34.64 
 
 
393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.531636  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4700  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.83 
 
 
384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.201387  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2570  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.25 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1948  isovaleryl-CoA dehydrogenase  31.85 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113187  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3360  isovaleryl-CoA dehydrogenase  34.41 
 
 
410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5032  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.58 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1645  isovaleryl-CoA dehydrogenase  33.66 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3387  isovaleryl-CoA dehydrogenase  31.76 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0103  isovaleryl-CoA dehydrogenase  33.41 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3274  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  32.41 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.93 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4391  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.92 
 
 
386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>